| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3202572 | 454 (0.650) | 29 (0.050) | 10/92 | NT | 8.2% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| ? | CP009273 | = 3202615 | 274 (0.480) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Only 100 of 639 total aligned reads displayed.
TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 | gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:49352874/1‑67 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:25140156/1‑67 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGAGcc > 1:20333658/1‑67 (MQ=255) cAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCAc < 1:11968000/67‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:10657577/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:40515326/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:53802624/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:16884766/68‑1 (MQ=255) aaCGAGTGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTTCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:34105378/68‑1 (MQ=255) ccGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:22498577/67‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:50522193/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:41482266/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:57953051/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:33924521/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:47009161/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:2950296/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:3064152/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:30263551/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGGGGCGTTGATTCTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:54888920/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGACGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:37951471/68‑1 (MQ=255) aCGATGGGGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:21506816/68‑1 (MQ=255) aCGATGGGGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:49616298/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:31376502/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:29043799/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:41980408/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:28694385/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:15626190/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:2398700/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt > 1:56507450/1‑68 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt > 1:23539974/1‑68 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:21923577/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:21225196/68‑1 (MQ=255) gatggtgatgggGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:32102417/68‑1 (MQ=255) ggtgatggcgGCGTTTATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGtata < 1:30320526/68‑1 (MQ=255) gatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATAcc > 1:19597651/1‑67 (MQ=255) gtggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:11538284/1‑66 (MQ=255) caggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:38576435/3‑66 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGTTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:11020385/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:39940815/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:26348450/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:54518615/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:48034784/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:7008352/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGc > 1:16281931/1‑66 (MQ=255) cGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCtctc > 1:12767643/1‑68 (MQ=255) cGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCtctc > 1:44951763/1‑68 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:48716783/68‑1 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:46675861/68‑1 (MQ=255) ttGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCAcc < 1:30807267/67‑1 (MQ=255) ttGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCAcc < 1:6469699/67‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGTCTTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:44116760/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:57766632/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:46113699/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:37272236/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:15089903/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:39327436/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:43266830/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:14486913/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:6193453/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCCCTCGCACCga < 1:7768635/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGGTTTATCTACTGCGCTACTTTCTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:8909278/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga > 1:11241508/1‑68 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga < 1:13373628/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGAACCgatga > 1:45279080/1‑68 (MQ=255) gtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatgatga < 1:35819456/68‑1 (MQ=255) tttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAtt < 1:52355621/68‑1 (MQ=255) ttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:49054539/55‑1 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct < 1:51419355/68‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCcgcagcaagcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgt > 1:34917187‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgt > 1:27347290‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgt > 1:28421407‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:10101163/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:42815451/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:5347506/1‑66 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtg > 1:56014006‑M1/1‑24 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:43584516/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTg > 1:33016010‑M2/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAAtgctgat > 1:17482178/1‑65 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:16003780‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:25724738‑M2/1‑66 (MQ=255) gcgcTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggaatacgccgtggc > 1:50763947‑M1/1‑21 (MQ=255) tACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggc > 1:40923207‑M2/1‑60 (MQ=255) tACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggc > 1:32736559‑M2/1‑60 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:45767095‑M2/1‑59 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATAGCTGCTgcgctggcg > 1:55020437‑M2/1‑59 (MQ=255) aCTTTTTCCCCAGCGCCACGGCGGATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:46397774‑M2/1‑59 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaa > 1:33638771‑M1/1‑14 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaa > 1:8265326‑M2/1‑57 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt > 1:38856451/1‑68 (MQ=255) attttCGCCAGCGACACGGCGTATACCTCCGCTCTGGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt < 1:13824182/67‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGcc > 1:53080047/1‑68 (MQ=255) cGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagt > 1:13147973‑M1/1‑9 (MQ=255) ccAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagta > 1:36305129‑M1/1‑7 (MQ=255) cAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagc > 1:57271987‑M2/1‑49 (MQ=255) cgcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgca > 1:2681042‑M1/1‑3 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgcag > 1:18582258‑M1/1‑2 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgcag > 1:56973824‑M1/1‑2 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgca < 1:27966274‑M1/67‑66 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgc < 1:2485104‑M1/66‑65 (MQ=255) gcCACGGCGTATACCTCCGCGCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgc > 1:48358655‑M2/1‑45 (MQ=255) | TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |