New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 2787742 = | 745 (1.060) | 62 (0.100) | 12/96 | NT | 9.8% | coding (131/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
? | CP009273 | 2787778 = | 503 (0.840) | coding (167/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
Only 100 of 921 total aligned reads displayed.
GTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTT > CP009273/2787711‑2787844 | gccaacatccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggct < 1:17518741‑M2/1‑1 (MQ=255) gTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt < 1:16431003/68‑1 (MQ=255) caacatccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTa < 1:56568376‑M2/2‑1 (MQ=255) caacatccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTAc < 1:24944560‑M2/3‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTa < 1:50278249/67‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTa < 1:13170640/67‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTa < 1:57402354/67‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:4359088/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:30707984/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:15705706/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:34892552/68‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:9423398/68‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:31619348/68‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtgg < 1:45079678/67‑1 (MQ=255) ccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:860857‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:2528708‑M2/9‑1 (MQ=255) cAGCTTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTAACTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:1418298/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGATGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:57040879/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:41925510/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:5846110/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:20246173/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:36878072/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:38890212/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:37604314/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:52776560/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:57581825/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:7644472/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:45640601/68‑1 (MQ=255) 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ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGCTGGTTATGATTATGCgg < 1:26162267‑M1/59‑1 (MQ=255) cGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGa < 1:5423892/68‑1 (MQ=255) cGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGa > 1:19399286/1‑68 (MQ=255) cGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg > 1:10538201/1‑68 (MQ=255) aGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGc < 1:50867501‑M1/67‑1 (MQ=255) aGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGc < 1:22559426‑M1/67‑1 (MQ=255) aGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGc < 1:53190545‑M1/67‑1 (MQ=255) CCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGTTTATGAGTATGCGGATTTTGGCgg < 1:23932322‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGaa < 1:21930575‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGaaa < 1:3226256‑M1/68‑1 (MQ=255) GCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAAt < 1:47405613‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATg < 1:819006‑M1/68‑1 (MQ=255) aTTTCTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCg < 1:49139883/67‑1 (MQ=255) aTTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTTGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCg < 1:53777986/67‑1 (MQ=255) aTTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCg < 1:24361232/67‑1 (MQ=255) aCTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTg < 1:46643022/68‑1 (MQ=255) aCTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTg < 1:4150535/68‑1 (MQ=255) aCTGGCCTATCTGATCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTg < 1:44571616/68‑1 (MQ=255) cTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTg > 1:9032957/1‑67 (MQ=255) tGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGcc > 1:28798159/1‑68 (MQ=255) 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tCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCg < 1:26438545/68‑1 (MQ=255) tCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCg < 1:31965630/68‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGa > 1:11024158/1‑68 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt < 1:32773218/68‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt < 1:28096150/68‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt < 1:29613894/68‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt > 1:19827006/1‑68 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt > 1:23569172/1‑68 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt > 1:15174696/1‑68 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGAGGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt < 1:46229280/68‑1 (MQ=255) 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tACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGtt < 1:39155022/67‑1 (MQ=255) tACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGtt < 1:49726587/67‑1 (MQ=255) | GTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTT > CP009273/2787711‑2787844 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |