| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 490 (0.790) | 67 (0.140) | 20/84 | NT | 15.7% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 350 (0.750) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630133‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAG > 1:8711464/1‑67 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTCACTCTTCGAGCAACGGCTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA < 1:49369551/67‑1 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA > 1:50668050/1‑67 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:3603824/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:43895632/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:26292038/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:23211369/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:22724330/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:4614173/1‑68 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:40509822/1‑68 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:13662505/1‑68 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAAGGCACCAGACCCGCGC > 1:11374733/1‑68 ACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCG < 1:7642610/68‑1 ACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCG < 1:27879628/68‑1 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG < 1:24566815/68‑1 CCGCCTGCACCTGTAACTCTTCTAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGCCCCGCGCGGGT < 1:38490845/67‑1 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC < 1:40405121/68‑1 aAGCACCTGTAACTCTTCGCGCAACGTTTTATGCAGAGTGAATGGCACCATACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:6151213/67‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:16169369/68‑1 cCCTGTAACGCTTCGCGCACCGGTTTCTGCAGAGTGAATGGCACCAGCCCGGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:29610799/67‑1 ACCTGTACCTCTTCGACCACCGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:23992552/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:18433184/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:21142087/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:8489517/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:39204803/66‑1 TGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTC < 1:28268675/68‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:10041429/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:42263955/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:44528607/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:22596817/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGGTTATGCAGAGGGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:9165520/67‑1 ACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGGCTGGGGCCATTCACTg > 1:6316777/1‑67 ACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGGCGGGTGGCATTCCCTC > 1:536797/1‑68 CTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGCCCCGCGCGGGTCGGGTGCCATTCcc > 1:45154522/1‑63 CTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC > 1:37858998/1‑65 TCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTG < 1:47941421/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:41969191/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:41288866/68‑1 CTTCCAGCAACGGTTTAGGCAGAGTCAATGGCACCAGACCCGCGCGGGGCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:33815402/68‑1 AGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAA > 1:34639541/1‑67 TTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTC > 1:28065136/1‑68 TGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGGCTGGTGCCGTTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAA > 1:22525527/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCCCTCTGCATTAACCGTTGCTCGAAG > 1:39444716/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGGATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:35617277/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:10950754/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:24129688/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTCCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:34207552/1‑68 CAGAGTGAATGGCACCCGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCGGCATAACCCGGTGCTCGAAGA > 1:43863950/1‑68 CAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGGCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA > 1:34451011/1‑68 CAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCCCTCTGCATAAAACGTTGCTCGTAGA > 1:37006762/1‑68 CAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATTAACCGTTGCTCGAAGc > 1:28873201/1‑67 AGACTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA < 1:3090661/67‑1 gtcAATGGCCCCCGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAG < 1:31562586/62‑1 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATACACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:37798142/1‑67 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:36582762/1‑67 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:21559699/1‑67 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:23426326/1‑67 TGGCACCAGCCCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT < 1:8626058/68‑1 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:10981618/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:25284649/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:40704929/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:40114178/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:3114666/1‑68 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:47768477/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:5410363/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:19185029/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:40315500/1‑66 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:25433091/1‑68 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:6589224/1‑68 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:5028809/1‑68 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGACTTACAGGTGCTG > 1:1177773/1‑68 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACGCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:45118103/1‑68 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCCTTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:37995557/1‑67 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCCCTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGGGCGGGCGG > 1:18143683/1‑67 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGCGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:25796403/1‑67 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:48803875/1‑67 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:37993774/1‑67 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:36285504/1‑67 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAGCCGGTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCGGGCGGGC > 1:38509197/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGATGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:7983445/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTAGAGGTGCTGGCGGGC < 1:6603933/68‑1 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC < 1:19995527/68‑1 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:37722769/1‑68 CCCGCGCGGGTCGGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGG < 1:17352845/67‑1 CGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAACCCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGT > 1:36956616/1‑68 GCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTG < 1:33878267/68‑1 GCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTG < 1:36595204/68‑1 GCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTG < 1:45216379/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:269109/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:46135421/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:45939566/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGATGCTCGAAGAGTTACAGGGGCTGGCGGGCGTGGC < 1:13214460/68‑1 CGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCG > 1:21457384/1‑68 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:42366164/1‑67 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:39567748/1‑67 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAA > 1:14363801/1‑37 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAATAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGC < 1:9060773/67‑1 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < 1:21860061/68‑1 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGC < 1:36969692/67‑1 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:1765555/1‑66 GGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630133‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |