| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 490 (0.790) | 67 (0.140) | 20/84 | NT | 15.7% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 350 (0.750) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 652 total aligned reads displayed.
AGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGACGC > CP009273/3630132‑3630266 | aGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCa > 1:11588132/1‑68 (MQ=255) aCCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgac < 1:38217934‑M2/67‑4 (MQ=255) gCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgc > 1:36440278‑M2/1‑61 (MQ=255) cACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgc < 1:33878267‑M2/68‑10 (MQ=255) gcccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcggg < 1:19995527‑M2/68‑13 (MQ=255) gcccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcggg > 1:37722769‑M2/1‑56 (MQ=255) cccgccAGCACCTGTAACTATTCGCGCTCCGGTTTATGCAGAGTGTATGGCACCAGACCCGCGCggg > 1:22190750/1‑67 (MQ=255) ccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAGGGCACCAgacccgcgcgggt > 1:37995557‑M2/1‑54 (MQ=255) cAGCACCTGTAACTCTTCGAGCACCGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggt > 1:40460154‑M2/1‑50 (MQ=255) cAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggt > 1:5028809‑M2/1‑50 (MQ=255) gCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgcagc > 1:45628283/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgcca > 1:40114178‑M2/1‑46 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgc > 1:40315500‑M2/1‑46 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgcca < 1:18433184‑M1/68‑9 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:6677358/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:31379280/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:27125583/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGAGGGTCGgcagca > 1:34415776/1‑67 (MQ=255) tAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGa > 1:21861226/1‑68 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgccccgcgcgggtctggtgccattcac > 1:21280296‑M2/1‑40 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcac > 1:23426326‑M2/1‑40 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcac < 1:42263955‑M1/67‑14 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcac < 1:10041429‑M1/67‑14 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:3363044/1‑68 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:13679723/1‑68 (MQ=255) aCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:49165261/1‑67 (MQ=255) aCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:13227555/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGCCCCGCGCGGGTCgggtgccattccc > 1:45154522‑M1/1‑52 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCTCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:1437255/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcac > 1:37858998‑M1/1‑52 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCCCGTTGAgg > 1:12023821/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgt > 1:48831633/1‑66 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:15288108/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:25537707/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:25864165/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:26332777/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:4353541/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:28856891/1‑67 (MQ=255) ctattCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATCGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:3191471/4‑67 (MQ=255) tctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGGGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctg < 1:9032690‑M1/68‑18 (MQ=255) ctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgc > 1:24129688‑M2/1‑36 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGCGGCCaa > 1:32651797/1‑68 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCaa < 1:1576751/68‑1 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAACGGCACCAgccccgcgcgggtctggtgccattcactctgca > 1:22525527‑M2/1‑35 (MQ=255) gAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataa > 1:28065136‑M2/1‑32 (MQ=255) aGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTg > 1:8145167/1‑68 (MQ=255) aGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTg > 1:44171851/1‑68 (MQ=255) aGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTg > 1:43076893/1‑68 (MQ=255) aGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTAGAGGCCAAATTg > 1:49650212/1‑68 (MQ=255) aGCAACGGATTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTg > 1:29245688/1‑68 (MQ=255) ttATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgct > 1:34639541‑M2/1‑22 (MQ=255) aTGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCt > 1:12794680/1‑68 (MQ=255) aTGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCt < 1:38760850/68‑1 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCtt > 1:36645934/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaag < 1:41288866‑M2/68‑51 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:46667077/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:27803963/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:47631448/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:39200911/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:28497471/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:14980636/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:37069530/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:5716812/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:35986637/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:44719152/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:25272304/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:5142172/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTAGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:47890270/1‑68 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTtat > 1:11039213/1‑68 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTtat > 1:31049424/1‑68 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTtat > 1:35334507/1‑68 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAGACCCCCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTtat > 1:16968697/1‑68 (MQ=255) cagtGAATGGCCCCAgccccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagt > 1:6316777‑M2/2‑15 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATC‑TATAACCa > 1:39685280/1‑68 (MQ=255) tGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCa > 1:30803697/1‑68 (MQ=255) tGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCa > 1:46904493/1‑68 (MQ=255) tGGCACCAGCCCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt < 1:8626058‑M1/68‑47 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt > 1:39413382‑M1/1‑22 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACg > 1:48113943/1‑68 (MQ=255) gCACCAgacccgcgcgggtcaggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt < 1:9395944‑M2/66‑61 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt > 1:19185029‑M1/1‑20 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt > 1:5410363‑M1/1‑20 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCGGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:10186101/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:29894435/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:23900240/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:50821059/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:20653531/1‑68 (MQ=255) aCCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggtgctg < 1:16169369‑M2/68‑65 (MQ=255) aCCAgacccgcgcgggtatggtgccattcactctgcataaaacgttgcgcgaagagttacaggtgctt < 1:6151213‑M2/68‑65 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAAtt > 1:17869566/1‑40 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:30355613/1‑67 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:10898322/1‑67 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:7699371/1‑67 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:42695689/1‑67 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:41794450/1‑67 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:23038187/1‑67 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:40730756/1‑67 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTGGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:29704875/1‑67 (MQ=255) aGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGAcgc > 1:19534530/1‑68 (MQ=255) aGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGAcgc > 1:45974285/1‑68 (MQ=255) | AGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGACGC > CP009273/3630132‑3630266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |