New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4583141 = | NA (NA) | 19 (0.040) | 7/90 | NT | NA | intergenic (+12/+37) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter |
? | CP009273 | 4583171 = | NA (NA) | intergenic (+42/+7) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4583218‑4583141 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttatcgggcatAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAGTGCC > CP009273/4583171‑4583235 TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAAGATTTTGCT > 1:36542781/1‑68 TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCT < 1:40130969/68‑1 TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCT > 1:47079949/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:12267023/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:26998141/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:28504349/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:35566600/1‑68 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GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGATTATC > 1:30246566/1‑68 GTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCG > 1:33956467/1‑68 GTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCG > 1:41290216/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCcg > 1:31695356/1‑66 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:26007334/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:33288371/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:35680313/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:37037630/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:47070582/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:39141468/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:24798936/1‑68 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |