| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3202855 = | NA (NA) | 9 (0.020) | 5/94 | NT | NA | intergenic (+9/+34) | ttdT/tsaD | L‑tartrate/succinate antiporte/tRNA(ANN) t(6)A37 threonylcarbamoyladenosine modification protein; glycation binding protein |
| ? | CP009273 | 3202881 = | NA (NA) | intergenic (+35/+8) | ttdT/tsaD | L‑tartrate/succinate antiporte/tRNA(ANN) t(6)A37 threonylcarbamoyladenosine modification protein; glycation binding protein | |||||
Only 100 of 857 total aligned reads displayed.
ATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCGCCAGCGGCCAGCGC > CP009273/3202789‑3202922 | atTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACgg > 1:50439545/1‑68 (MQ=255) ttCCTCGTCTTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGGGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:13039091/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGCCGGt < 1:40509103/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:351168/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt > 1:28192410/1‑68 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:18239286/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:24128215/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:1612438/68‑1 (MQ=255) atctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgggg > 1:22719034‑M1/65‑66 (MQ=255) atctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGt > 1:43084948‑M1/65‑67 (MQ=255) atctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGt > 1:36066239‑M1/65‑67 (MQ=255) atctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGt > 1:7503501‑M1/65‑67 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:46398971/1‑68 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:50753328/1‑68 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:45309760/1‑68 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:5566146/1‑68 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:43407128/1‑68 (MQ=255) tcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgg < 1:12475299‑M1/1‑1 (MQ=255) cggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGTGCCgg > 1:46060567‑M1/61‑68 (MQ=255) cggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGTGCCgg > 1:20703646‑M1/61‑68 (MQ=255) cGTAATGCTGGGGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCgg < 1:27902477/68‑1 (MQ=255) ttGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAAt < 1:36666801/68‑1 (MQ=255) cTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAAtt > 1:25729458/1‑66 (MQ=255) ggTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGa > 1:22041189/1‑60 (MQ=255) ggTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:41875283/1‑66 (MQ=255) ggTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:4070087/1‑66 (MQ=255) ggTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:36497992/1‑66 (MQ=255) gATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTcc > 1:19321097/1‑68 (MQ=255) gATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTcc > 1:18874243/1‑68 (MQ=255) aTTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTcc < 1:46586802/67‑1 (MQ=255) aTTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCg > 1:24653221/1‑68 (MQ=255) aTTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAAATGCACTCCg > 1:40095303/1‑68 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:35715509/1‑67 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:30235388/1‑67 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:16580506/1‑67 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:49661176/1‑67 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTT‑AGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCa > 1:17081914/1‑67 (MQ=255) ccGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAc < 1:45089118/68‑1 (MQ=255) cGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCGGGCAcc < 1:9477238/68‑1 (MQ=255) cGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAcc < 1:11259433/68‑1 (MQ=255) ggCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAccc > 1:10228247/1‑68 (MQ=255) gctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa > 1:19709760‑M1/41‑68 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCaa > 1:1531681/1‑68 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:8274358/67‑1 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:4427522/67‑1 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:3375182/67‑1 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:6917451/67‑1 (MQ=255) attACTGTGGATGACCTTGGTGTTGCTTTTCGTGAGTACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:35420341/66‑1 (MQ=255) aCTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAg > 1:10009336/1‑68 (MQ=255) aCTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAg < 1:37461478/68‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGt < 1:4243695/68‑1 (MQ=255) tgtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtt > 1:26206321/1‑68 (MQ=255) tgtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCCGCACCCAATAGtt > 1:5220254/1‑68 (MQ=255) gtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGttt > 1:41438922/1‑68 (MQ=255) gtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGttt > 1:50046216/1‑68 (MQ=255) gtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGttt > 1:11902074/1‑68 (MQ=255) gtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGttt < 1:46851779/68‑1 (MQ=255) ggATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtttt > 1:793567/1‑67 (MQ=255) aTGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTAc > 1:15633038/1‑67 (MQ=255) 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aCGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGATTTACGCAGCCGGTAACTCCgccagcggccagc > 1:29039965/1‑68 (MQ=255) | ATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCGCCAGCGGCCAGCGC > CP009273/3202789‑3202922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |