| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 610426 | 255 (0.410) | 34 (0.060) | 5/96 | NT | 11.5% | coding (814/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | CP009273 | = 610453 | 303 (0.570) | coding (841/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent | |||||
Only 100 of 624 total aligned reads displayed.
GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTT > CP009273/610360‑610493 | gATTTAGCCCTTGGGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:50575553/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg > 1:36285765/1‑68 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg > 1:18908242/1‑68 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:42395642/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAAGCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:49020667/68‑1 (MQ=255) aTTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCGGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:33558213/68‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:41384892/67‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:15728532/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:43701318/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:31831185/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:12851989/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:40817753/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:20755546/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:49765004/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTCGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:3096989/1‑68 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:46554397/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:35361396/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:18021192/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:122797/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:35722657/1‑66 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:28610914/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:19597573/66‑1 (MQ=255) cTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCtt < 1:40209337/68‑1 (MQ=255) cTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCtt < 1:13403707/68‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGc > 1:11303792/1‑68 (MQ=255) tGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGt < 1:21362084/68‑1 (MQ=255) gCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCg > 1:29460232/1‑68 (MQ=255) cAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCg < 1:42702689/67‑1 (MQ=255) cAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCg < 1:4841659/67‑1 (MQ=255) tgtgGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGc < 1:9563152/68‑1 (MQ=255) tgtgGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGc < 1:45548657/68‑1 (MQ=255) ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg > 1:37559680‑M2/1‑66 (MQ=255) ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg > 1:5252018‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:26926654‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:10565995‑M2/68‑5 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:51126662‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:43986576‑M2/1‑60 (MQ=255) gCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcg > 1:16833156‑M2/1‑59 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGgcgc < 1:8249495/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:19303782‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:17541961‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:14856568‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:14394183/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:44432529/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATCCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:13895352‑M2/1‑55 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:47303064‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:5399053‑M2/1‑54 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccat > 1:38306018‑M2/1‑51 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:25678046/67‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:7495544/68‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:36456079/68‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagtccat > 1:49394050‑M2/1‑51 (MQ=255) ccAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTCTCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:10300632/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:3431669/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:6614751/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:29099611‑M2/1‑49 (MQ=255) aaTCGAATGGACTCCGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCGcggcggcgtagtccatacg > 1:34057459‑M2/1‑49 (MQ=255) aaGCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:5602058‑M2/1‑49 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgatt > 1:45062489‑M1/1‑19 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacgatt > 1:21105560‑M2/1‑46 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:26472536/1‑68 (MQ=255) aTGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGAc > 1:21753008/1‑67 (MQ=255) aTGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacgattgc > 1:27664234‑M2/1‑43 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcaca > 1:38273495‑M1/1‑14 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcaca > 1:28415326‑M1/1‑14 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:43347448/1‑68 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:200844‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:36984842‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:17288187‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:38409332‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:12021048‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:12656440‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:22719468‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:24984435/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:50705312/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:8928451/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:23685425/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:1663814/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:39233783/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:39608098/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:32834224/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:32363359/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:20295284/1‑67 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTg < 1:29608119/67‑1 (MQ=255) gccgccGcgcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:22627318‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacattcgcc > 1:23439220‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:270911‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgc < 1:2302424‑M1/66‑60 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtaggccataagattgcacaatcgcc > 1:15827963‑M1/1‑7 (MQ=255) GCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa < 1:24622220‑M1/67‑1 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccc > 1:5917585‑M1/1‑6 (MQ=255) CCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:7109085‑M1/68‑1 (MQ=255) CCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:2997684‑M1/68‑1 (MQ=255) CGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:7873353‑M1/1‑67 (MQ=255) gccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccca > 1:37131748‑M1/1‑4 (MQ=255) GCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGt > 1:46314578‑M1/1‑68 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagcc > 1:331794‑M1/1‑2 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagcc < 1:43139316‑M1/68‑67 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagc < 1:41737023‑M1/67‑66 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagc < 1:47952846‑M1/67‑66 (MQ=255) | GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTT > CP009273/610360‑610493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |