| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 610426 | 255 (0.410) | 34 (0.060) | 5/96 | NT | 11.5% | coding (814/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | CP009273 | = 610453 | 303 (0.570) | coding (841/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent | |||||
Only 100 of 497 total aligned reads displayed.
GGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCA > CP009273/610388‑610520 | ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:43139316‑M2/68‑3 (MQ=255) gCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:40057482‑M2/67‑3 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:36985399‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:26926654‑M2/68‑5 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:42583634‑M2/1‑62 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCGcggcggc > 1:22627318‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGAATGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:23439220‑M2/1‑60 (MQ=255) gCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:12717437‑M2/66‑8 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:12114919‑M2/65‑8 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGgcgc < 1:8249495/67‑1 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGgcgc < 1:14935679/67‑1 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGgcgc < 1:39533750/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:28668349‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:44205192‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:44432529/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCGcggcggcgtagt > 1:29543628‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTAATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:45177416‑M2/1‑55 (MQ=255) ctgcgcAATCGTAAGGACTACGCCGCCGGCTTTATCTTTATGCGCCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:12942337‑M2/2‑55 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:33270931‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:1543246‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACg > 1:29068020/1‑68 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACg > 1:17277217/1‑68 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:38373113/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:36394997/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:6012801/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:21094066/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:21347189/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:3431669/67‑1 (MQ=255) aaTCGTAGGGACTCCGCCGCCGGATTTCTCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:43721448‑M2/1‑49 (MQ=255) aaGCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:5602058‑M2/1‑49 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAcc < 1:19918767/68‑1 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAcc < 1:23227102/68‑1 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:10864841/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:26472536/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:19273862/1‑68 (MQ=255) gTATGGACTCCTCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCGCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGa < 1:7498110/68‑1 (MQ=255) gTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGa < 1:19531085/68‑1 (MQ=255) aTGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacgattgc > 1:27722936‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGAcc < 1:49115648/68‑1 (MQ=255) aTGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGAc > 1:41627193/1‑67 (MQ=255) aTGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGAc > 1:21753008/1‑67 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:4697093/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTAGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:20213882/1‑68 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:34693947/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:32363359/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:38262559/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:39233783/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:5128898/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:49438098/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:47670920/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:16882475/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:1663814/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:22943651/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:14632767/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:25865183/1‑67 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:35397447/1‑66 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTg < 1:14270253/67‑1 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGc < 1:50950181/68‑1 (MQ=255) GCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa < 1:13565546‑M1/67‑1 (MQ=255) GCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa < 1:32960957‑M1/67‑1 (MQ=255) GCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa < 1:36693570‑M1/67‑1 (MQ=255) CCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:24143591‑M1/68‑1 (MQ=255) CGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:15885833‑M1/1‑67 (MQ=255) CGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:2370556‑M1/1‑67 (MQ=255) CGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCGCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACg > 1:50662567‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGt > 1:31416407‑M1/1‑68 (MQ=255) GGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGtttt > 1:48230695‑M1/1‑68 (MQ=255) aTTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTg > 1:24919696/1‑67 (MQ=255) tttATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGcc < 1:2446029/68‑1 (MQ=255) tttATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGc < 1:12613272/67‑1 (MQ=255) tCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTg > 1:48706732/1‑68 (MQ=255) tCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTg < 1:14002280/68‑1 (MQ=255) tCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTg < 1:42776068/68‑1 (MQ=255) tCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTg < 1:7880641/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:9539053/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:7049609/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:6867033/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:46099506/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:40467323/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:8889078/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:33749363/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:37450380/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:29932782/68‑1 (MQ=255) tttATGCGGCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:10185280/68‑1 (MQ=255) ttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGt < 1:40856441/68‑1 (MQ=255) ttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGt < 1:25234399/68‑1 (MQ=255) ttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGt < 1:30153218/68‑1 (MQ=255) tATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTa < 1:11627215/68‑1 (MQ=255) tATGCGTCGACTGGGCGCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTa < 1:43459279/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt > 1:29217453/1‑68 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt < 1:35984561/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAt > 1:27119053/1‑67 (MQ=255) gCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTc < 1:5396931/68‑1 (MQ=255) gCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTc > 1:17798624/1‑68 (MQ=255) gTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTcac < 1:20806156/68‑1 (MQ=255) gTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTcac > 1:18526165/1‑68 (MQ=255) gACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACAtt > 1:5761273/1‑68 (MQ=255) gCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTgcggc > 1:32656803/1‑67 (MQ=255) gCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTgcggc < 1:10431737/67‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCa > 1:3884066/1‑68 (MQ=255) | GGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCA > CP009273/610388‑610520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |