| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 726727 = | NA (NA) | 3 (0.000) +C |
3/110 | NT | NA | coding (1689/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | 726730 = | NA (NA) | coding (1692/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 905 total aligned reads displayed.
GCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTT > CP009273/726660‑726780 | tCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCAc < 1:10755916/68‑1 (MQ=255) ctgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACcgc < 1:22605024/68‑1 (MQ=255) gactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGa > 1:34024148/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGCCGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:11224380/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:10025613/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:3788635/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:40605572/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:5495646/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:28891916/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:1229768/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg < 1:23360377/67‑1 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg < 1:26183399/67‑1 (MQ=255) tgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGa > 1:17021759/1‑68 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:16629603/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:43331867/1‑67 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:40082851/1‑67 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGGCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:19546841/68‑1 (MQ=255) ggTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:21881706/1‑65 (MQ=255) ggTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:33232072/1‑65 (MQ=255) ggTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:28185094/1‑65 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGCCCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:26572588/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:35915508/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:20450838/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:41986500/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:27301241/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:46637656/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:23721843/1‑68 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:30315393/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:9428750/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:8713414/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:777444/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:6372877/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:29366265/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:47778035/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:38383165/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:31184498/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:45297026/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:42558552/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:38930308/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:25676392/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:15687303/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:1492787/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:14524111/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:22922561/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:14094182/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:1376700/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGATGAg < 1:31704949/68‑1 (MQ=255) tAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAg > 1:13590957/1‑68 (MQ=255) tAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAg > 1:8287101/1‑68 (MQ=255) tAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAg > 1:44940691/1‑68 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:22165672/1‑68 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:42832229/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:48358072/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:49632483/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:11572350/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:19085526/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:37508211/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:25518461/1‑68 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGTTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:15884099/68‑1 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc > 1:44531306/1‑68 (MQ=255) atgaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCa > 1:18122366/1‑68 (MQ=255) tgaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGCCGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCAt > 1:50935746/1‑68 (MQ=255) gaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATa < 1:50069463/68‑1 (MQ=255) gaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATa < 1:50517523/68‑1 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:29849461/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:15439918/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:33721955/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:40868199/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:24383834/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGCCGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:32008037/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:51220422/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg < 1:5800305/68‑1 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:45533830/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:13081128/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:46220480/1‑68 (MQ=255) ccaagaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTTCACCGCGAGGAAGGCCTCATTCAGTACCGCGCCTagc > 1:21509241/1‑66 (MQ=17) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:47281965/1‑67 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:48845352/1‑67 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:36386670/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:6904397/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:36889968/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:11846894/1‑67 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGcc > 1:20060137/1‑68 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:45815806/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:32613666/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:27715203/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:43883799/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:21061791/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:17823648/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:18644074/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:39514741/67‑1 (MQ=255) cGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCg > 1:41365376/1‑68 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg < 1:28549103/68‑1 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg > 1:3074389/1‑68 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg < 1:25020510/68‑1 (MQ=255) ggTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACa < 1:35330818/68‑1 (MQ=40) gctCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACa < 1:7387608/66‑1 (MQ=37) tCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt > 1:34654560/1‑68 (MQ=37) tCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt > 1:26871727/1‑68 (MQ=37) cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:17384357/67‑1 (MQ=35) | GCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTT > CP009273/726660‑726780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |