| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 726727 = | NA (NA) | 3 (0.000) +C |
3/110 | NT | NA | coding (1689/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | 726730 = | NA (NA) | coding (1692/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 891 total aligned reads displayed.
TCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTT > CP009273/726663‑726780 | actgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGATCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCAcc > 1:26984948/1‑67 (MQ=255) actgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCAcc > 1:20419394/1‑67 (MQ=255) tgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACcgcg > 1:4724956/1‑68 (MQ=255) actgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg < 1:22614432/68‑1 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGCCGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:11224380/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGTTGCACCGCGAg < 1:24630043/67‑1 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:10025613/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:32788871/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:13640660/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:3788635/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:40605572/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg < 1:26250149/67‑1 (MQ=255) tgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGa > 1:10663061/1‑68 (MQ=255) tgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGa > 1:17021759/1‑68 (MQ=255) tcgggTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg < 1:8851817/65‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:16629603/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:40082851/1‑67 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:43331867/1‑67 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGGCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:19546841/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGCAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:12380693/68‑1 (MQ=255) ccGGCTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:6939010/68‑1 (MQ=255) ggTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:5888895/1‑65 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:35915508/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:27359485/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:51256005/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:41986500/1‑68 (MQ=255) tttGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTTGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:23746454/66‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:50940865/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:37421295/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:38383165/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:34025798/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:38930308/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:46195986/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:7416966/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:31218625/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:30824174/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:28659440/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:42558552/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:45297026/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:31737584/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:13116463/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:15687303/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg > 1:21596452/1‑68 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:2102097/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:22926281/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:1379593/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:14198443/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCAATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:4775205/68‑1 (MQ=255) gTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCa > 1:33290989/1‑68 (MQ=255) tAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAg > 1:44940691/1‑68 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:42832229/1‑68 (MQ=255) aCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:2942943/1‑67 (MQ=255) cccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:25143173/1‑67 (MQ=255) cccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:9432265/1‑67 (MQ=255) cccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGAACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:14568499/1‑67 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:49632483/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:19085526/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:20049572/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:26657665/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:28235413/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:11572350/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:32055823/1‑68 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGTTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:15884099/68‑1 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:46545912/68‑1 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc > 1:44531306/1‑68 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc > 1:29864724/1‑68 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:25519845/68‑1 (MQ=255) gaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATa < 1:50069463/68‑1 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:40868199/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:15439918/1‑68 (MQ=255) ccatgcccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:28979535/1‑67 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:18245983/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:30318978/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg < 1:8334534/68‑1 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:7777563/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:45533830/1‑68 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:643316/1‑67 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:48845352/1‑67 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:36386670/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:25800210/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:11846894/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:1497935/1‑67 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGcc > 1:27828336/1‑68 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGcc > 1:36888371/1‑68 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:45815806/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:43883799/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:17823648/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:18644074/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:5498820/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:39514741/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:21898902/67‑1 (MQ=255) cGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCg > 1:33760628/1‑68 (MQ=255) cGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCg > 1:41365376/1‑68 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg > 1:48135259/1‑68 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg < 1:22182682/68‑1 (MQ=255) ggTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACa < 1:35330818/68‑1 (MQ=40) tCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt > 1:34654560/1‑68 (MQ=37) cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:50568185/67‑1 (MQ=35) cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:17384357/67‑1 (MQ=35) cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:23402704/67‑1 (MQ=35) | TCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTT > CP009273/726663‑726780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |