| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2787742 = | 749 (1.210) | 52 (0.100) | 11/96 | NT | 8.8% | coding (131/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
| ? | CP009273 | 2787778 = | 437 (0.820) | coding (167/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter | |||||
Only 100 of 955 total aligned reads displayed.
TGTCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCG > CP009273/2787676‑2787809 | tgtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCggg > 1:30985568/1‑67 (MQ=255)acgaaccggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtag < 1:26297968‑M1/1‑1 (MQ=255) gtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGc > 1:32063675/1‑67 (MQ=255) gaaccggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGccc > 1:38803678‑M1/65‑68 (MQ=255) gaaccggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGccc > 1:42296837‑M1/65‑68 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg < 1:17157638/68‑1 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:27714463/1‑68 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:7759953/1‑68 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:39196006/1‑68 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:1798243/1‑68 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGACGGTTTGTCGGTTCCAGCGGCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:47406077/1‑68 (MQ=255) aaccggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCcg < 1:43650670‑M1/5‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggc > 1:43911036/1‑68 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggc > 1:41191827/1‑68 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:4003520/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:10046354/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:363729/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:2662535/68‑1 (MQ=255) cggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCcggcg > 1:11914468‑M1/61‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:15667958/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:29977406/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt < 1:41598494/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:50280841/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:34556396/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt < 1:36865711/68‑1 (MQ=255) cGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTAGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTa < 1:37402862/67‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:12900826/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:13326928/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:13763156/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:9470858/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:35470551/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:27313360/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:33613761/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:25247389/68‑1 (MQ=255) tgtTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt > 1:25603973/1‑66 (MQ=255) gtTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt > 1:40649990/1‑65 (MQ=255) tATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTgg < 1:15431082/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTg < 1:12442406/67‑1 (MQ=255) tATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTg < 1:48016164/67‑1 (MQ=255) aTCGTCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCATCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:21464864/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:26960608/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:39515419/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:258861/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:2223794/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:6569465/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:11021116/68‑1 (MQ=255) ggCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTa < 1:34943653/68‑1 (MQ=255) gcAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCt < 1:28185112/68‑1 (MQ=255) cAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTa > 1:30302353/1‑64 (MQ=255) gccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCCGGCGGGATTACTGGCCGATCTGt < 1:9802473‑M1/27‑1 (MQ=255) ccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagttGCCCGGCGGGATTACTGGCGGATCTgttg < 1:46159431‑M1/29‑2 (MQ=255) tCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTc > 1:16137916/1‑67 (MQ=255) tttccgccaacatccgcattatcataaccaccagtaGCCCGGCGGTATTTCTGGGCTAGATGGTCGcc < 1:23088167‑M1/32‑1 (MQ=255) tttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCCGGCGGGTTTACTGGCCTAGCTGTTGGcc < 1:14917138‑M1/32‑1 (MQ=255) tGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGcc < 1:20989313/68‑1 (MQ=255) gTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCg > 1:18336151/1‑68 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCggg < 1:45417865/68‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCgg > 1:49814490/1‑67 (MQ=255) ttGTCGGGTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCggg < 1:42454536/68‑1 (MQ=255) gTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt < 1:6101986/68‑1 (MQ=255) gTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt < 1:46813407/68‑1 (MQ=255) gTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt < 1:14451020/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:5366367/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:7062506/68‑1 (MQ=255) ggTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATc > 1:24762967/1‑52 (MQ=255) ggTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt > 1:45062292/1‑65 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:21806970/68‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:12170476/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:38188256/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:4449925/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:16530976/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:4912129/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:22654159/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:7255758/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:33078383/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:32637036/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:11366976/68‑1 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:8986325/1‑68 (MQ=255) 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ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg < 1:19094888‑M1/59‑1 (MQ=255) ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg < 1:18593084‑M1/59‑1 (MQ=255) ccGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg > 1:51111932/1‑68 (MQ=255) ccGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg > 1:36052927/1‑68 (MQ=255) caccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGa < 1:2930698‑M1/60‑1 (MQ=255) accagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGAt < 1:10493760‑M1/61‑1 (MQ=255) aGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGt < 1:24320042/68‑1 (MQ=255) gCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGtt > 1:17701909/1‑68 (MQ=255) gtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg < 1:48870788‑M1/65‑1 (MQ=255) cGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg > 1:589295/1‑68 (MQ=255) gggCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTgg < 1:23623775/68‑1 (MQ=255) gggCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg < 1:8332887/67‑1 (MQ=255) | TGTCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCG > CP009273/2787676‑2787809 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |