| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4034176 | NA (NA) | 36 (0.070) | 12/92 | NT | 7.2% | intergenic (+180/+90) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B |
| ? | CP009273 | = 4034200 | 563 (0.910) | intergenic (+204/+66) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B | |||||
Only 100 of 1436 total aligned reads displayed.
GGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCT > CP009273/4034133‑4034266 | gggCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTT > 1:51217481‑M2/1‑68 (MQ=255) aCGCCCGCCATAAACTGCAAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGTCCTTTTTGCA‑t > 1:49806817/1‑68 (MQ=255) aTAAACTGCCATGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGa < 1:30485536/68‑1 (MQ=255) aTAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGa < 1:6879845/68‑1 (MQ=255) aCTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGaaaaa > 1:28340827/1‑68 (MQ=255) aCTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGaaaaa > 1:12101434/1‑68 (MQ=255) aCTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGaaaaa > 1:5998132/1‑68 (MQ=255) aCTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGaaaaa > 1:13443280/1‑68 (MQ=255) gCCAGGCATCAAAATAAGCAGAAGCCCCTCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcag > 1:32144746‑M2/1‑45 (MQ=255) cAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATg > 1:16079887/1‑67 (MQ=255) cATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCgg < 1:29972616/67‑1 (MQ=255) aTCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGAt > 1:46623294/1‑68 (MQ=255) aaaTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCg < 1:47098284/68‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGAc < 1:1898823/68‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGAc > 1:34437769/1‑68 (MQ=255) aGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:13098443/1‑68 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:45275132/1‑67 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:27179544/1‑67 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:14541342/1‑67 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:38666295/1‑67 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTATGGA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:10006256/1‑67 (MQ=255) cAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGgc > 1:13776391/1‑68 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGcgcg < 1:5490928/67‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:23062324/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:42769415/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:17036858/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:42265165/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:49444075/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:50639447/68‑1 (MQ=255) gCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCt > 1:10571780/1‑68 (MQ=255) gACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGc < 1:14908723/68‑1 (MQ=255) gACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGc < 1:8527902/68‑1 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:40195012/1‑68 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATACAGCCt > 1:3567993/1‑68 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:12679810‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:16710626‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:17847064‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:19380280‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:41594509‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgaagcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:44844066‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:20364924/1‑67 (MQ=255) ggATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:41966240/1‑67 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:37251880‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:2666607‑M2/68‑60 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:25340578‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:11540801‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:2891592‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:48339428‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:2766413‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:26381000‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:44214198‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc > 1:15692409‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc > 1:23518020‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:4120519‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:47476922‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:9053792‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:31712156‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:35013307‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:11096901‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:23859766‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:25780018‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctcccggccg < 1:20818102‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAc < 1:36785677/67‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAc < 1:38183525/67‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTTTCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAct < 1:40722261/67‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAct < 1:24270652/67‑1 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:46087309‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:2118850‑M2/68‑63 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:19773253‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcggcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:22014828‑M2/1‑6 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:43075297‑M2/66‑63 (MQ=255) ccTTTTTGCA‑TTTGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt < 1:32680702/67‑1 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggggtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:31292347‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:18264368‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:50197960‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:6400232‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:48903067‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:14155759‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:7612466‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:12356727‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:21463845‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:35998713‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:2244292‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:2603310‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:28002817‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:29324595‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:29596433‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:39318638‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:47849919‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:33595660‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:15364324‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:8060550‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatatgaggccgggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:2484747‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:39699753/67‑1 (MQ=255) cTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:33078988/67‑1 (MQ=255) ttttttCATTTGGCCCATAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGTGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:4353162/67‑1 (MQ=21) tttttGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCt < 1:9579829/68‑1 (MQ=255) ttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:5785768‑M2/67‑66 (MQ=255) tctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgtgccgatgctt < 1:17449883‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttc < 1:37695697‑M2/68‑68 (MQ=255) | GGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCA‑TTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCT > CP009273/4034133‑4034266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |