| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2845465 = | 356 (0.580) | 29 (0.050) | 11/96 | NT | 6.8% | coding (243/273 nt) | hypC | hydrogenase maturation protein |
| ? | CP009273 | 2845525 = | 487 (0.920) | coding (31/1122 nt) | hypD | hydrogenase maturation protein | |||||
Only 100 of 708 total aligned reads displayed.
CGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAA > CP009273/2845458‑2845590 | cctgttccggcgcgcgatattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgg < 1:15788452‑M2/1‑1 (MQ=255)cGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCgg < 1:8816415/68‑1 (MQ=255)cGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCgg < 1:49446396/68‑1 (MQ=255) tgttcCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGa < 1:20352018‑M1/62‑1 (MQ=255) aTGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCG‑TTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACa > 1:32839006/1‑68 (MQ=255) tGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACa > 1:29200189/1‑68 (MQ=255) tcCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAg < 1:21825067‑M1/66‑1 (MQ=255) gTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAg < 1:4068441/68‑1 (MQ=255) CGGCGCGCTGTTGTATGTCGAGGAAAAATAATGCGTTCTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGt > 1:47642516‑M1/1‑68 (MQ=255) CGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGa > 1:10073633‑M1/1‑67 (MQ=255) GCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGAt > 1:24428693‑M1/1‑67 (MQ=255) tgttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAg < 1:12059046/67‑1 (MQ=255) gttattcatcaactaaacgcattatttttcctcgacatacaacagcgcgccgGAACAGGTGATGCAg < 1:5299264‑M2/15‑1 (MQ=255) ggttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTTATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAg < 1:38358845/66‑1 (MQ=255) ggttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATTAATATCGCGCGCCGTAACAGTTGATGCAg < 1:39776777/66‑1 (MQ=255) tattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgGAACAGGTGATGCAGtt < 1:36086410‑M2/17‑1 (MQ=255) tattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgGAACAGGTGATGCAGTTa < 1:13246914‑M2/18‑1 (MQ=255) tgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTaa < 1:38692863/68‑1 (MQ=255) tgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTaa > 1:6340586/1‑68 (MQ=255) tgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTaa > 1:35306934/1‑68 (MQ=255) tgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTa < 1:35646494/67‑1 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:20738540/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:27397324/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:29963031/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:220921/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:43345891/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:7933343/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:18055843/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:17742523/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTATTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:3940485/1‑68 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:33194694/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:42233292/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:4548244/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:32301641/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:31173174/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:30507183/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:29699600/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:43208324/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:47222440/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:50849251/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:11459774/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:14975895/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:16440094/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:16984210/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:18422341/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:22519982/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:6881506/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:26694495/1‑67 (MQ=255) gAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCa > 1:43576222/1‑67 (MQ=255) aaaaaTAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCt < 1:28844604/66‑1 (MQ=255) aaaaTAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTgc < 1:5642875/67‑1 (MQ=255) aaaaTAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTgc < 1:19407802/67‑1 (MQ=255) ataatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGa > 1:1442492/1‑68 (MQ=255) taatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGaa < 1:8387631/68‑1 (MQ=255) taatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGa > 1:31548968/1‑67 (MQ=255) taatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGa > 1:6522091/1‑67 (MQ=255) taatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGa > 1:49874143/1‑67 (MQ=255) aatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAAc > 1:37491735/1‑68 (MQ=255) aatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAAc > 1:40227503/1‑68 (MQ=255) aatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAAc > 1:45615077/1‑68 (MQ=255) aatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAAc > 1:7440848/1‑68 (MQ=255) tGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGt < 1:37108286/68‑1 (MQ=255) tGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGt < 1:19766568/68‑1 (MQ=255) gCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGt > 1:23981400/1‑67 (MQ=255) gCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTg < 1:45909502/68‑1 (MQ=255) gTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCt > 1:12771753/1‑68 (MQ=255) ttgttgATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTc < 1:44703605/67‑1 (MQ=255) tgttgATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTcac < 1:41113450/68‑1 (MQ=255) gttgATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTcaca > 1:14740603/1‑68 (MQ=255) tgatgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTcaca > 1:9085332/1‑66 (MQ=255) gatgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtct < 1:4163153/68‑1 (MQ=255) gatgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtct < 1:33673849/68‑1 (MQ=255) gatgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTCCACAtct < 1:17278830/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTTCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:48780201/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:48434949/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:5037102/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:9543398/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:10428848/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:14036473/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:15387437/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:28476536/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:2779/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:23491708/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctc > 1:5455638/1‑67 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctc > 1:46737858/1‑67 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctc > 1:26262413/1‑67 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGGTAATTGCGCATCTGCGCGATCGTGCTTCCCAtctc > 1:34370338/1‑67 (MQ=255) gaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctc > 1:48122872/1‑66 (MQ=255) aaTATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATctctct > 1:46318849/1‑68 (MQ=255) aaTATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATctctct > 1:25595126/1‑68 (MQ=255) aaTATCGCGCGCCCGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATctctct > 1:41412932/1‑68 (MQ=255) atCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTac > 1:27016281/1‑68 (MQ=255) atCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTac > 1:10841204/1‑68 (MQ=255) atCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTac > 1:21468385/1‑68 (MQ=255) atCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTac > 1:37878111/1‑68 (MQ=255) atCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTac > 1:44292791/1‑68 (MQ=255) cgcgcgCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTaca > 1:10612154/1‑67 (MQ=255) gcgcgccgGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACAcc > 1:42944243‑M2/9‑68 (MQ=255) cgcgccgGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACAcc > 1:1896686‑M2/8‑67 (MQ=255) gcgccgGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACAccg > 1:597241‑M2/7‑67 (MQ=255) | CGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAA > CP009273/2845458‑2845590 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |