| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 471426 | 293 (0.810) | 19 (0.070) | 7/88 | NT | 6.5% | intergenic (+19/+12) | ybaY/ybaZ | outer membrane lipoprotein/excision repair protein, alkyltransferase‑like protein ATL |
| ? | CP009273 | = 471428 | 317 (1.120) | intergenic (+21/+10) | ybaY/ybaZ | outer membrane lipoprotein/excision repair protein, alkyltransferase‑like protein ATL | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/471348‑471426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaccctctccgGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < CP009273/471428‑471362 TCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTT < 1:28006862/68‑1 GACTTCACCAACTCCGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA < 1:5585969/68‑1 GACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA < 1:16879527/68‑1 GACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA < 1:12318443/68‑1 GACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA < 1:12559428/68‑1 ACTTCACCAACTCCGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCATACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:18849784/1‑67 ACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:163390/1‑67 ACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:17237314/1‑67 ACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:4015440/1‑67 ACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:24165135/1‑67 ACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:806344/1‑67 ACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGATAA > 1:3742749/1‑67 ACTTCACAAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:23405981/1‑67 CTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAAC > 1:15851951/1‑67 TCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCT < 1:27187990/68‑1 TCACCAACTCAGGTGAATCCGGCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCT < 1:12126430/68‑1 CCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCT > 1:4395950/1‑67 CCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCT > 1:18063023/1‑67 CAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCC > 1:14774924/1‑68 AACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCG < 1:5819480/68‑1 AACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCG < 1:4829705/68‑1 AACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCG < 1:6939353/68‑1 AACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCC > 1:3280919/1‑67 CTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGGGGAGAGGGTTAACGGCGCTTTATATTGCG > 1:10269464/1‑68 CTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGgg > 1:12634474/1‑66 CTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCG > 1:15602446/1‑68 CTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCG > 1:19481935/1‑68 CTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTGAATATTGCG > 1:19278604/1‑68 CCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGGGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGGGTA > 1:6529885/1‑68 GCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGA > 1:5134504/1‑66 ATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGG > 1:28549012/1‑68 ATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGA > 1:7311220/1‑67 GCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCC > 1:28298689/1‑68 GCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCC > 1:29700147/1‑68 GCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCC > 1:23581578/1‑68 GCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCC > 1:9356521/1‑68 TAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACG > 1:11935301/1‑68 AACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGG < 1:13377846/68‑1 AACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGG < 1:13980498/68‑1 ACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGA > 1:5922626/1‑68 ACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGA > 1:15942804/1‑68 CCCTCTCCGGGGGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:7486511/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGGGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCGGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:20295320/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGATGACGGAT > 1:16300304/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGTCGGAT > 1:18292292/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:2679084/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:19822173/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:17710828/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:27434189/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:27647040/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:27795366/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:28110323/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:16687206/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:14575635/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:8289103/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:8525381/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:24735366/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT < 1:20007372/68‑1 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:23802526/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:23714848/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:25747012/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:22052223/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:22202026/1‑68 CCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGGTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:23402187/1‑67 CCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:13017028/1‑67 CCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:10308607/1‑67 CCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:8031813/1‑67 CCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:6336111/1‑67 CCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:12705956/1‑67 CCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:21454144/1‑67 CCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:2294875/1‑67 CCTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:28185278/1‑67 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGATCTGCCGAAGACGGATTC > 1:13115560/1‑68 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTC > 1:29723790/1‑68 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTC > 1:9293164/1‑68 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTC > 1:21942502/1‑68 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTC > 1:525177/1‑68 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTC > 1:5492953/1‑68 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTC > 1:21236535/1‑68 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTC > 1:6117317/1‑68 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTC > 1:18588697/1‑68 CTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTCCCGAAGACGGATTC > 1:4621016/1‑68 TCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA < 1:26013325/68‑1 TCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA < 1:19487442/68‑1 TCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA < 1:10364147/68‑1 TCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA < 1:11466813/68‑1 TCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA < 1:22802732/68‑1 TCTCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA < 1:3092588/68‑1 TCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA > 1:6896473/1‑66 TCCGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA > 1:2013224/1‑66 CGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTG > 1:16702666/1‑68 CGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTG > 1:7885577/1‑68 CGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTG > 1:27526424/1‑68 CGGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTG > 1:17716394/1‑68 GGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:21185830/68‑1 GGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:6903633/68‑1 GGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:11134469/68‑1 GGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:12792093/68‑1 GGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:15551685/68‑1 GGGCGGAGAGGGTTAAAGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:646443/68‑1 TCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/471348‑471426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaccctctccgGGCGGAGAGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < CP009273/471428‑471362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |