| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2691481 | 342 (0.950) | 35 (0.110) | 10/100 | NT | 9.7% | coding (429/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound |
| ? | CP009273 | = 2691501 | 348 (1.080) | coding (409/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2691410‑2691481‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggctgCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGTT < CP009273/2691501‑2691435 TGTGCGACTTTTGCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATGCCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:20491442/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGAGAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:21367498/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:19283977/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:3887564/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:21463534/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:27805521/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:25995341/1‑68 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCCCCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:3617153/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:25931791/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:29351675/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:6814877/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:6066332/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:11902305/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:13664697/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:20767401/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:17623809/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:8392177/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:1683054/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:1109479/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:25841629/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:25817107/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:1604045/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:3685176/1‑66 CGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:5133156/1‑68 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:17195256/1‑67 TGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTta > 1:3679188/1‑66 ACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCG > 1:20167254/1‑68 ACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATC > 1:6985459/1‑67 ACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCG > 1:29309253/1‑68 ACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCG > 1:313676/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTTATCTTTTCGCCAGCCAAATTCTGCGT > 1:10074331/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGg > 1:1568331/1‑67 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:18904689/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:10742659/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:22386429/1‑68 AGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGGGGCTATGGTGGT > 1:15131738/1‑68 GCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTT > 1:15198879/1‑68 GCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTT > 1:13591776/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:4706738/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:26905575/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:719836/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:1070116/1‑68 CACGCTGAATTTGGGTGCCGCGGGTTTATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCGTTGGTGGTTGG > 1:2677434/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTTTCGCCAGCCAAATTCAGCGGGGGTTTGGTGGTTGG > 1:12343040/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:5335388/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:9214108/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:24887860/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:15545960/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:13843015/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGGTGG > 1:7390537/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGGTGG > 1:18663383/1‑68 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:10696696/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:23264709/68‑1 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGGTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:27994928/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:16266258/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:25662840/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:4085374/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:6653562/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:19766536/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:27000798/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGGGGTTGGGTATTGACGCTGC > 1:26539843/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGTCGATGCG > 1:16115471/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:13474572/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:6117408/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:6152278/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:13970864/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:6733487/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:4983173/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:13074588/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:4720746/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:15484141/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:4478121/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:12647776/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:1200202/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:11449674/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:3376150/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:16138449/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:23328651/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:3185083/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:242409/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:177634/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:29076584/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:2598957/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:27055848/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:19889028/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:2110072/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:21313153/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:6145712/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACAATGCG > 1:19814485/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGGGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:3619066/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGAGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:8754137/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:26517702/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT < 1:27985295/68‑1 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT < 1:25612055/68‑1 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT < 1:8076965/68‑1 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:16580322/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:24033083/1‑68 GCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGTT < 1:29661447/68‑1 GCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGTT < 1:23027898/68‑1 GCCGCGGGGTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGTT < 1:22359066/68‑1 TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2691410‑2691481‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggctgCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGTT < CP009273/2691501‑2691435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |