| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 261 (0.730) | 40 (0.150) | 16/84 | NT | 17.4% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 184 (0.680) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630134‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAG > 1:19081027/1‑67 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGA > 1:25903533/1‑67 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGA < 1:16171337/67‑1 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGA > 1:15186295/1‑67 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGA > 1:28846655/1‑67 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGA < 1:9301242/67‑1 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGA > 1:1139671/1‑67 CGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCG < 1:8603706/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGC < 1:15432026/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGC < 1:20917509/68‑1 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCG < 1:24409823/67‑1 ACGCCCGCCAGCTCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCG < 1:21017974/68‑1 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGG < 1:27710997/68‑1 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:3539827/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:15565917/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGG < 1:23231385/68‑1 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGG < 1:14056039/68‑1 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:3468348/1‑68 CCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:26191554/1‑67 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTTTGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTC > 1:19316471/1‑68 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGCCCCGCGCGGGT < 1:834382/67‑1 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTC > 1:2423070/1‑68 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGT < 1:28255434/67‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCCGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:27177018/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:16732788/68‑1 cCCTGAAACTCTTCGAGCACCGGTTTATCCAGAGGTAAT‑GCCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:17315083/67‑1 ACCTGTAACTCTTCGCGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:20155395/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:23123728/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:29203986/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:12877358/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:23148061/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:22875522/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:17065107/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:18350365/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:18875902/66‑1 ACCTGTAACTCTGCGCGCAACGGTTTATGCCGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:20800882/66‑1 CCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:5267178/68‑1 CCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:5301219/68‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:13450983/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:26331864/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:24953028/67‑1 ACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTGTGGTGCCATTCACTC > 1:17440536/1‑68 CTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGGCTGGTGCCATTCAC > 1:2962536/1‑65 TCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTG > 1:18320618/1‑68 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:20235487/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:4907154/68‑1 CTTCCACCAACGTTTTATGCTGAGTTAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:17245689/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGCGAAT‑GGCACCAGACCCCCCCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:19283552/67‑1 AGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGCCCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGGATAA > 1:21798250/1‑67 TTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCT < 1:2070129/67‑1 ATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTGTGGTGCCATTGACTCTGCATAAACCGTTGCTggg > 1:12483631/1‑65 TGCACAGTGACG‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAA < 1:3060398/68‑1 GCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATGAACCGTTGCTCGAAG > 1:8871702/1‑68 GCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:5795481/1‑68 GCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:29712901/1‑68 CAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA > 1:5064700/1‑68 GTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:10619152/1‑67 GTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:22983276/1‑67 GTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:6602842/1‑67 GTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAG < 1:5760344/65‑1 T‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:11396564/1‑68 T‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACGCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:25265679/1‑68 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAGTCTGCATAAACCGTTGCTCGATGAGTTACAGGT > 1:28656430/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:5664644/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:4822877/1‑66 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTTGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:28062283/1‑68 GACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG < 1:4723160/68‑1 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:7617777/1‑67 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:1262759/1‑67 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:28434319/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:7344771/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:538639/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:26257642/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGG < 1:27182894/67‑1 CCCGCGCGGGTCGGGGGCCATTCATTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGG < 1:19998720/67‑1 GCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTG < 1:28530490/68‑1 GCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTG < 1:16484190/68‑1 GCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTG < 1:6062772/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:4662805/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:15095228/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:17033474/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:27290629/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:6505964/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGG < 1:15082921/67‑1 GGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGG < 1:25099558/68‑1 GGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGG < 1:14943/68‑1 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:16931191/1‑67 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:18465597/1‑67 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < 1:14861439/68‑1 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGC < 1:23662299/67‑1 GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAT‑GGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630134‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |