| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4328027 = | 177 (0.490) | 13 (0.040) | 8/96 | NT | 6.3% | intergenic (‑281/+44) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase |
| ? | CP009273 | 4328055 = | 235 (0.760) | intergenic (‑309/+16) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase | |||||
TTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4328098‑4328027‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attacgccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCCC > CP009273/4328055‑4328121 TTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTA < 1:28813347/68‑1TTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATT > 1:9709792/1‑67 TACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTAC < 1:5843158/68‑1 ACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG < 1:15308094/68‑1 ACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTAC > 1:15324619/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTTCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:19903635/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:10106642/1‑67 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CP009273/4328098‑4328027‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attacgccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCCC > CP009273/4328055‑4328121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |