New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4506708 = | 290 (0.810) | 20 (0.070) | 11/94 | NT | 8.4% | coding (827/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
? | CP009273 | 4506742 = | 191 (0.630) | coding (793/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4506782‑4506708 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > CP009273/4506742‑4506807 TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCC < 1:18414151/67‑1 AAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGC < 1:4572081/68‑1 AAACCGCTGGGGGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGC < 1:6906527/68‑1 AACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:7713528/68‑1 AACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:13607747/68‑1 AACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:19338068/68‑1 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:1753119/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:29496069/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:26772524/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:820656/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:16039454/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:18773627/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:26167290/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:14706849/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:6324896/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:6602460/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:6606191/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:714433/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:7387193/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:21013452/1‑68 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT < 1:20979390/68‑1 cgtTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:20460773/65‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACTCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:9446860/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:17571487/1‑68 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:639188/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:26661015/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:8641051/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:19394410/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACCGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:6129607/68‑1 CGCTGGGGGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:4913509/68‑1 CGCGGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGATACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:13927544/68‑1 GCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:18734279/1‑67 GCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:5652570/1‑67 GCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:18577713/1‑67 GCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:23043548/1‑67 GCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:1171568/1‑67 gGGGGGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCACCGGCGGGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC < 1:19262318/66‑1 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC < 1:28886897/67‑1 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC < 1:3109837/67‑1 TGGGGGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCG < 1:7675124/68‑1 GGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGG < 1:12549995/68‑1 GTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCACAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGT < 1:13265726/67‑1 GGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGGGATCCCGCCGTTGCGGTAACG < 1:1710944/67‑1 TGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGG < 1:6377559/66‑1 TGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGGGCTGCGCTGCGAGCCCGCCGTTGCGGTAACGG < 1:9170893/66‑1 tcGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAG < 1:22187439/66‑1 aAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAG < 1:269192/67‑1 TAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAG < 1:8989642/68‑1 acCCACGCAAACCCGTTCCCGCAACGGCGGGCTGCGCGGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGC < 1:20175464/66‑1 AGCCACGCTAACCCGTTACCGCACCGGCGTGCTGCGCTGCGAGCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGC < 1:4886575/68‑1 CACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCG < 1:25956392/66‑1 ACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGG < 1:14996811/68‑1 CGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:2117929/68‑1 CGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGACCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:25589558/68‑1 CGCTAACCCGCAACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:20575387/68‑1 CGCTAACCCCTGACCGCAACGGCGCGCAGCGCTGCGATCCCGCCGGTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:2415899/68‑1 CGGCGTGCGGCGCGGCCAACCCGCCGTGGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGT < 1:12151223/68‑1 CGGCGGGCGGCGCTGCGATCCCCCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGT < 1:104381/68‑1 TGCGCGGCCAACCCGCCGTGGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCGCACCCAGCGGTTTATCGC < 1:23639367/67‑1 gcCGACCCCGCCGTTGCGTTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAG < 1:10964026/65‑1 gGCGATCGCGCCGTTGCGGAACCGGGTAAGGGTGGCAATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAG < 1:6470960/66‑1 TGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGC < 1:18813367/68‑1 cCCCGCCGTTCCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGG < 1:6376791/67‑1 CCCCCCGTGGCGGTAACGGGTTAGCGGGGCAAGCACCGCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGA < 1:15148922/68‑1 CCCCCCGTCGCGGAAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGA < 1:17803634/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:6327355/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:16155735/68‑1 CCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT > 1:24530420/1‑67 CCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT > 1:3144075/1‑67 CCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT > 1:12545994/1‑67 CGTTGCGGTAACGGTTTAGCGTGGCTATCACCTCACACAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:17881084/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:576551/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:22289275/68‑1 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TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4506782‑4506708 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > CP009273/4506742‑4506807 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |