New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4512275 = | 297 (0.830) | 16 (0.050) | 6/92 | NT | 5.5% | coding (1637/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
? | CP009273 | 4512318 = | 303 (1.020) | coding (1594/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4512351‑4512275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgcatcggTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCTT > CP009273/4512318‑4512383 CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGC > 1:26233731/1‑68 CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGC > 1:25902738/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:9292583/1‑68 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTTATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:13467036/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:14217026/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:17691334/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:2976181/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:29318744/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:29097837/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:2343782/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:2276463/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:22412206/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:1768977/1‑67 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:20627343/1‑67 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACAGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:18197010/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:13537626/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTATCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:3224906/68‑1 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:3548715/1‑67 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:4872178/1‑67 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:14788556/1‑67 CATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGAATCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC > 1:5406435/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG < 1:24560317/68‑1 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG < 1:16463274/68‑1 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:3147575/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:12156661/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:18967376/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:13192485/1‑68 tcCGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:26471439/66‑1 TACGGTAAGCCTGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:12839137/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:26847572/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:25631944/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:2354327/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:12807315/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:25651234/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:12058739/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:20806459/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:20234542/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:10352465/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:12513082/1‑67 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:7096663/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGTGTGCATCGG > 1:13594369/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGT < 1:16048803/68‑1 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:27356439/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:16453034/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:8669713/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:29520505/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:9490488/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:29374362/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:18790285/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:27553264/1‑67 TTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:2477874/68‑1 TTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:16155012/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:28499533/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:1006261/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:6559312/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:11194885/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:11444465/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGGGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:3379598/68‑1 ACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGT < 1:7724097/68‑1 ACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGT < 1:28453315/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:17224395/68‑1 ggcCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGG < 1:7936317/65‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |