| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2436008 | 299 (0.830) | 21 (0.070) | 7/94 | NT | 8.0% | coding (766/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme |
| ? | CP009273 | = 2436093 | 234 (0.770) | coding (851/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme | |||||
Only 100 of 386 total aligned reads displayed.
GGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGT > CP009273/2435942‑2436074 | gggCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTg < 1:4051708/68‑1 (MQ=255)gggCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTg > 1:26313247/1‑68 (MQ=255)gggCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTg < 1:7295239/68‑1 (MQ=255)gggCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTg < 1:21646844/68‑1 (MQ=255) ggCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTgg > 1:1551658/1‑68 (MQ=255) ggCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTgg > 1:1067148/1‑68 (MQ=255) ggCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTgg > 1:11804175/1‑68 (MQ=255) cgcAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGt < 1:16377137/67‑1 (MQ=255) aCGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAAcc < 1:22142830/68‑1 (MQ=255) gAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCAc > 1:23334237/1‑68 (MQ=255) aaTGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACgg < 1:16851481/68‑1 (MQ=255) ctGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACggg < 1:7567545/67‑1 (MQ=255) aTGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACggg < 1:16574014/68‑1 (MQ=255) aTGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACggg < 1:18049087/68‑1 (MQ=255) aTGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACggg < 1:4886117/68‑1 (MQ=255) tGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgc > 1:19075244/1‑68 (MQ=255) tGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgc > 1:18154337/1‑68 (MQ=255) tGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgc > 1:20029212/1‑68 (MQ=255) tGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgc > 1:8221306/1‑68 (MQ=255) tGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgc > 1:27416836/1‑68 (MQ=255) tGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgc > 1:25477196/1‑68 (MQ=255) cTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgca > 1:13383902/1‑67 (MQ=255) tttGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgcagc < 1:24183082/68‑1 (MQ=255) gCGGGGGGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgcagcagc < 1:1483782/68‑1 (MQ=255) ggTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCaaa < 1:1512409/67‑1 (MQ=255) ggTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCaaa < 1:12459386/67‑1 (MQ=255) tGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCCTGGTTTAACCGCACGGCCAGCAGCAAACgg > 1:4569026/1‑68 (MQ=255) ggAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGaa > 1:10108885/1‑67 (MQ=255) gAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgc > 1:29749807/1‑68 (MQ=255) aaCAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgcg > 1:25150342/1‑68 (MQ=255) aaCAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgcg > 1:20508003/1‑68 (MQ=255) aaCAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgcg > 1:1088223/1‑68 (MQ=255) aaCAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgcg > 1:29079403/1‑68 (MQ=255) cAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgcggc > 1:12610049/1‑68 (MQ=255) aGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgcggcg > 1:19279517/1‑68 (MQ=255) aCATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGAt > 1:9625486/1‑68 (MQ=255) aCATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGAt > 1:7893670/1‑68 (MQ=255) cATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGAtt > 1:27912585/1‑68 (MQ=255) aTTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTa < 1:1113096/68‑1 (MQ=255) aCCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTactagcgccagcgccacccccgcgctggcactaccaccgccgata > 1:24893258‑M1/1‑23 (MQ=255) aCCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcg > 1:26547154/1‑68 (MQ=255) aCCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcg > 1:18771561/1‑68 (MQ=255) aCCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcg > 1:906501/1‑68 (MQ=255) ccGCTCCCCTGCTCCGCGGCGTaatagcgccagcgagaacaacgcgctggcaataccaccgcggatga > 1:27842650‑M1/1‑22 (MQ=255) ccGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcg > 1:8521611/1‑67 (MQ=255) ccGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcg > 1:23464094/1‑67 (MQ=255) ccGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcg > 1:16122138/1‑67 (MQ=255) ccGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcg > 1:17040870/1‑67 (MQ=255) ccGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGAGTATcg > 1:668526/1‑67 (MQ=255) cGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcggc > 1:17410738/1‑68 (MQ=255) cGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcggc > 1:22328298/1‑68 (MQ=255) cGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcggc < 1:556070/68‑1 (MQ=255) cGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcggc < 1:25845975/68‑1 (MQ=255) cGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcggc > 1:5407075/1‑68 (MQ=255) gCTCCCCTGCTCCGCGCCGTaatagcgccagcgaccacaacgcgctggcaatacccccgccgatactc > 1:22948275‑M1/1‑20 (MQ=255) gCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAACCGGGAAGCGGCGATTATcggcg > 1:3779432/1‑68 (MQ=255) gCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcggcg > 1:2563723/1‑68 (MQ=255) tCCCCTGCTCCGCGCCGTaatagcgcccgcgtcaacaacgcgctggcaattccaccgccgaaaatcgc > 1:9771417‑M1/1‑18 (MQ=255) tCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggt > 1:15856659/1‑68 (MQ=255) tCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggt > 1:5883867/1‑68 (MQ=255) tCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggt > 1:19744955/1‑68 (MQ=255) tCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggt < 1:28752319/68‑1 (MQ=255) ccccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtg < 1:22541441/68‑1 (MQ=255) cccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtgg < 1:2411316/68‑1 (MQ=255) cccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtgg < 1:14670013/68‑1 (MQ=255) cccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtgg < 1:14188890/68‑1 (MQ=255) cccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtgg < 1:21291277/68‑1 (MQ=255) cccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtgg < 1:21911576/68‑1 (MQ=255) cccTGCGCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtgg < 1:9283186/68‑1 (MQ=255) ccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtggt > 1:24642207/1‑68 (MQ=255) gCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCTGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTAtt > 1:6937935/1‑68 (MQ=255) gCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTAtt > 1:14372803/1‑68 (MQ=255) tCCGCGCCGTaatagcgccagcgacaacaacgcgctggcaataccaccgccgataatcgccgcttccc > 1:13673492‑M1/1‑10 (MQ=255) tCCGCGCCGTaatagcgccagcgacaacaacgcgctggcaataccaccgccgataatcgccgcttccc > 1:17503721‑M1/1‑10 (MQ=255) tCCGCGCCGTaatagcgccagcgacaacaacgcgctggcaataccaccgccgataaccgccgcttccc > 1:12734858‑M1/1‑10 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAACCGGGCAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:6560841/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:11604287/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:11374877/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:7360366/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:7091869/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:10944684/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:10390651/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:463241/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:17184527/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:17776797/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:19368393/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:3616282/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:3437828/1‑67 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg > 1:2680623/1‑67 (MQ=255) 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cGTaatagcgccagcgacaacaacgcgctggcaataccaccgccgataatcgccgcttcccgtttgc < 1:6063461‑M1/67‑65 (MQ=255) | GGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGT > CP009273/2435942‑2436074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |