| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2787742 = | 414 (1.150) | 32 (0.100) | 9/96 | NT | 8.9% | coding (131/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
| ? | CP009273 | 2787778 = | 297 (0.960) | coding (167/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter | |||||
Only 100 of 535 total aligned reads displayed.
TGTCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGC > CP009273/2787676‑2787808 | tgtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTGTGTTTGTCGGGTGCAGGGGCGGCGTCGCCGAGGCGGGc > 1:25180607/1‑68 (MQ=255)tgtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCggg > 1:27967139/1‑67 (MQ=255) gtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGc > 1:12649105/1‑67 (MQ=255) gtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGc > 1:28689920/1‑67 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:806364/1‑68 (MQ=255) accggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCcgg > 1:17063913‑M1/63‑68 (MQ=255) ccggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCcggc > 1:22278363‑M1/62‑68 (MQ=255) ccggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCcggc > 1:4810040‑M1/62‑68 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGcgggccgggc > 1:26517656/1‑68 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggc > 1:11629604/1‑68 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggc > 1:2006070/1‑68 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:28939191/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:3178351/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:25958458/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:5623666/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:18206700/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:17747956/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:9444679/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:14991158/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:8389624/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:7816781/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGGCTGTTTGTCGGTGCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:13073781/68‑1 (MQ=255) tGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCCGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcgg > 1:7022292/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:28536603/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:4090768/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:19374016/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt < 1:26839367/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt < 1:6569601/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:17551916/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:6008855/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt < 1:10202459/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:16657608/1‑68 (MQ=255) cGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTa < 1:23743841/67‑1 (MQ=255) cGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTa < 1:8658566/67‑1 (MQ=255) cGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAt < 1:6292466/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:29332471/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:29628352/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:22401064/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:21037303/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:13224088/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:1874957/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGGCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:1180432/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTgg < 1:15964716/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTgg < 1:16832881/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCAGGCGGTATTACTgg < 1:24027559/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGCAAGTCTGTTAGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTg < 1:12441344/67‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:20236482/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:12029366/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:5751706/68‑1 (MQ=255) cGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCt > 1:3584669/1‑68 (MQ=255) cGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCt > 1:10635705/1‑68 (MQ=255) ggCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTa < 1:15325712/68‑1 (MQ=255) cgcAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTAt < 1:2069834/67‑1 (MQ=255) gcAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATc < 1:24607327/67‑1 (MQ=255) ccatttccgccaacatccgcataataataaacaccagtaGCCCGGCGGTTTTACTGGGCTATGTGTTc < 1:2038262‑M1/29‑1 (MQ=255) tGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGcc < 1:13737355/68‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCggg < 1:11142379/68‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCggg < 1:10918078/68‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCggg < 1:18447140/68‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCggg < 1:16340913/68‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCgg > 1:29154838/1‑67 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCgg < 1:3882630/67‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGGCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCggg < 1:26280450/68‑1 (MQ=255) tGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGc < 1:23064158/68‑1 (MQ=255) tGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGc < 1:2326835/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTa < 1:27700662/67‑1 (MQ=255) ggTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt > 1:27431902/1‑65 (MQ=255) ttCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtg < 1:17369601/67‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:18985181/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:1040435/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:8982280/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:8224368/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:1448001/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:7132744/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:5324459/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:25418421/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCAGCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTCTTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:2978981/68‑1 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:7493405/1‑68 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:21783106/1‑68 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:22855314/1‑68 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:22569072/1‑68 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:14718952/1‑68 (MQ=255) gTCGCCAGCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGtt < 1:16519495/66‑1 (MQ=255) ataatcataaccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGGCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTAt < 1:3379717‑M1/49‑1 (MQ=255) tCGCCATCGCCGAAGCTGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTCTg < 1:5037924/68‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCTGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCTGGCTACTGGTGGTTATg < 1:20811974/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:21474611/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:27043001/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:8843793/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:19688443/67‑1 (MQ=255) atcataaccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGAt < 1:15646900‑M1/52‑1 (MQ=255) cataaccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTa < 1:4539582‑M1/54‑1 (MQ=255) aTCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGTTTATGATTAt < 1:4346969/68‑1 (MQ=255) aTCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTAt < 1:19475690/68‑1 (MQ=255) aTCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTAt < 1:1127608/68‑1 (MQ=255) ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg < 1:14337769‑M1/59‑1 (MQ=255) cGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg > 1:23534524/1‑68 (MQ=255) cGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg > 1:21274133/1‑68 (MQ=255) cGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg > 1:28336302/1‑68 (MQ=255) gggCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTgg < 1:13499694/68‑1 (MQ=255) | TGTCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGC > CP009273/2787676‑2787808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |