New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 2787742 = | 414 (1.150) | 32 (0.100) | 9/96 | NT | 8.9% | coding (131/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
? | CP009273 | 2787778 = | 297 (0.960) | coding (167/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
Only 100 of 513 total aligned reads displayed.
GTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTT > CP009273/2787711‑2787844 | gccaacatccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggct < 1:14186293‑M2/1‑1 (MQ=255) gTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt < 1:23097896/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:22016269/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:28874669/68‑1 (MQ=255) cGGTGCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGATATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:17023089/68‑1 (MQ=255) ggTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt > 1:3467596/1‑65 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:24193899/68‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:151327/68‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:12094881/68‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtgg < 1:27830124/67‑1 (MQ=255) tccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtg < 1:26872934‑M2/8‑1 (MQ=255) ccgcataatcttaaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:29331051‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcataatcatcaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:5715923‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:13699575‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:26564089‑M2/9‑1 (MQ=255) cAGGGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:20891193/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGTAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:20228890/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:8224368/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:16422686/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:5324459/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:28408717/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:2947717/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:3259957/68‑1 (MQ=255) aGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTggtggt > 1:19558313/1‑68 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:7622421/1‑68 (MQ=255) gTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTggtggt < 1:18370952/65‑1 (MQ=255) taatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACTGGTGGTTATg < 1:4539582‑M2/14‑1 (MQ=255) taatcataaccaccagtagcccggcgaacagatagcccagtaataccgccgggcTACTGGTGGTTATg < 1:20668725‑M2/14‑1 (MQ=255) tCGCCATCGCCGAAGCTGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTCTg < 1:5037924/68‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:19777477/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:26338711/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:9328044/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:15371812/67‑1 (MQ=255) aatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACTGGTGGTTATGa < 1:7453400‑M2/15‑1 (MQ=255) gCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTACGAt < 1:21437646/68‑1 (MQ=255) atcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACTGGTGGTTATGAt < 1:15646900‑M2/16‑1 (MQ=255) cataaccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTa < 1:8720891‑M1/54‑1 (MQ=255) ataacccccagtagcccggcgaaccgatcggccagtaaaaccgccgggcTACTGGTGGTTATGATTAt < 1:11279925‑M2/19‑1 (MQ=255) aTCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTAt < 1:3062467/68‑1 (MQ=255) ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg < 1:9754722‑M1/59‑1 (MQ=255) ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg < 1:13493154‑M1/59‑1 (MQ=255) aGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGt > 1:14612905/1‑68 (MQ=255) cGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg > 1:7946494/1‑68 (MQ=255) aGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGc < 1:22421242‑M1/67‑1 (MQ=255) CCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCgg < 1:16576425‑M1/68‑1 (MQ=255) CCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCgg < 1:12771643‑M1/68‑1 (MQ=255) CCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGa < 1:14904567‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGaaa < 1:23707508‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATg < 1:15808625‑M1/68‑1 (MQ=255) aTTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCgg > 1:24729843/1‑68 (MQ=255) aCTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTg < 1:29809398/68‑1 (MQ=255) cTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTg > 1:14341292/1‑67 (MQ=255) cTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGc < 1:28066448/68‑1 (MQ=255) tGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGcc > 1:13085573/1‑68 (MQ=255) tGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGcc > 1:20602372/1‑68 (MQ=255) tGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGcc > 1:13545646/1‑68 (MQ=255) tGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGcc > 1:4002222/1‑68 (MQ=255) tGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCCGAAATGGCGGTTGcc > 1:25526864/1‑68 (MQ=255) gCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCAc > 1:13358339/1‑68 (MQ=255) ccTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCAc > 1:27121291/1‑67 (MQ=255) ccTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCAc > 1:22616234/1‑67 (MQ=255) ccTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCAc > 1:10624145/1‑67 (MQ=255) ccTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCAc > 1:11140913/1‑67 (MQ=255) ccTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAAACGCCGTTGCCAc > 1:19409820/1‑67 (MQ=255) cagtaataccgccgggcTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACg > 1:18963399‑M2/18‑67 (MQ=255) cTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGc < 1:16759960/68‑1 (MQ=255) cTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGc < 1:4256464/68‑1 (MQ=255) cTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGc < 1:19104399/68‑1 (MQ=255) cTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGc < 1:29145459/68‑1 (MQ=255) cTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGc < 1:6681144/68‑1 (MQ=255) cTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGc < 1:2354482/68‑1 (MQ=255) tATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGcc < 1:28527596/68‑1 (MQ=255) tATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGcc < 1:14720873/68‑1 (MQ=255) tATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGcc < 1:10861768/68‑1 (MQ=255) aTCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGccc < 1:17557807/68‑1 (MQ=255) tCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCg < 1:7212281/68‑1 (MQ=255) tCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCg < 1:21675317/68‑1 (MQ=255) tCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCg < 1:16116203/68‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGa > 1:12486911/1‑68 (MQ=255) cTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGa > 1:11467208/1‑68 (MQ=255) cTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGa > 1:13945901/1‑68 (MQ=255) cTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGa > 1:26671044/1‑68 (MQ=255) cTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGa > 1:28981633/1‑68 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCTCGAt > 1:10440112/1‑68 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt > 1:18127279/1‑68 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt < 1:25824752/68‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt > 1:6977199/1‑68 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGAt < 1:24490281/68‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCAACGCCCGAt > 1:9255742/1‑68 (MQ=255) tCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATAcc > 1:18707228/1‑68 (MQ=255) cgccgggcTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCg > 1:8869385‑M2/9‑68 (MQ=255) cgggcTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGtt < 1:11702685‑M2/63‑1 (MQ=255) cTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGt < 1:17737660‑M2/66‑1 (MQ=255) cTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGt < 1:25233198‑M2/66‑1 (MQ=255) cTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGt < 1:6291152‑M2/66‑1 (MQ=255) cTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGATCGt < 1:2758385‑M2/66‑1 (MQ=255) tACTGTTGGTTAGGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGtt < 1:10012510/67‑1 (MQ=255) tACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGtt < 1:5514398/67‑1 (MQ=255) tACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGtt < 1:4927696/67‑1 (MQ=255) tACTGGTGGTGATGATTATGCGCAAGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGtt < 1:21233114/67‑1 (MQ=255) | GTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTT > CP009273/2787711‑2787844 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |