| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3202572 | 250 (0.690) | 13 (0.040) | 7/92 | NT | 7.3% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| ? | CP009273 | = 3202615 | 127 (0.430) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
ACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGG > CP009273/3202549‑3202682 | aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGGACCGATGATGATtgctgct > 1:18789231/1‑67 (MQ=255)aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:21302184/1‑67 (MQ=255)aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:29630958/1‑67 (MQ=255)aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:8991575/1‑67 (MQ=255)aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:26349529/1‑67 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:24003893‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:13752297‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTCCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:7388946‑M2/1‑66 (MQ=255) gcgcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgc > 1:5548674‑M2/1‑64 (MQ=255) gcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctg < 1:15310701‑M2/68‑7 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:14402250‑M2/1‑59 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt < 1:21185445/68‑1 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt > 1:22841268/1‑68 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt < 1:4876065/68‑1 (MQ=255) tttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGc < 1:15550325/68‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGcc < 1:25984453/68‑1 (MQ=255) cGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcg < 1:19733241‑M2/55‑4 (MQ=255) gCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGa > 1:12625453/1‑68 (MQ=255) cAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagc > 1:7364618‑M2/1‑49 (MQ=255) gcgcCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgc > 1:10855721‑M2/1‑47 (MQ=255) gcCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATc < 1:25465761/66‑1 (MQ=255) cccaCGGCGTATACCACCGCGCTCGCCCCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcg > 1:24829308‑M2/2‑45 (MQ=255) ccACGGCGTATACCTCCGCGCACGCTCCGAAGATGATTGCGGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:28178933‑M2/1‑44 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:26038134‑M2/1‑43 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCTCTCCCACCGATGATGATTGCTGCGgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:20238377‑M2/1‑43 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCGCTCGCACCGATCATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:5760965‑M2/1‑43 (MQ=255) aCGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGACGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtag > 1:13216898‑M2/1‑42 (MQ=255) cGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTg < 1:3483717/68‑1 (MQ=255) ggCGGATACCACCGCTCTCGCACCGAAGATGATTGCAGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtagat > 1:5076469‑M2/1‑40 (MQ=255) cGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGcc < 1:18993890/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtg < 1:11943168/68‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtg < 1:1413698/68‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgt < 1:7998337/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgt < 1:6011537/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgt < 1:17805512/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgt < 1:10309324/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgt < 1:29384994/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCCCTCGCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAAT‑CCGCTGCCGgtgt < 1:26563938/68‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt < 1:23412816/68‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt < 1:5909619/68‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt < 1:6881871/68‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt < 1:24278287/68‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt < 1:27483222/68‑1 (MQ=255) aCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:17567464/1‑67 (MQ=255) aCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:4163250/1‑67 (MQ=255) aCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:17770795/1‑67 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:18513091/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:351608/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:8249612/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:11071894/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:20178525/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTc < 1:1922918/68‑1 (MQ=255) cTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt < 1:24690082/68‑1 (MQ=255) tCCGCTCTCGGACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:21931803/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:7554984/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:23759263/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:16625831/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:6207031/1‑67 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:24108996/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:4079800/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:19143161/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:26897144/68‑1 (MQ=255) cGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTg > 1:3428666/1‑66 (MQ=255) cGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTTcc < 1:9392015/68‑1 (MQ=255) tctcGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGa > 1:12905521/1‑68 (MQ=255) tctcGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGa < 1:28615728/68‑1 (MQ=255) tctcGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGa < 1:9347653/68‑1 (MQ=255) tcGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtg < 1:17633252/68‑1 (MQ=255) cGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtgg > 1:23204753/1‑68 (MQ=255) cGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtgg < 1:16196583/68‑1 (MQ=255) cGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtgg < 1:5689579/68‑1 (MQ=255) gCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGGTCTGCCTGAtgg < 1:23031663/67‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:25683161/68‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:13274356/68‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATACCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:12410064/68‑1 (MQ=255) gatgatgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTg < 1:21683454/68‑1 (MQ=255) gatgatTGCTGGTGCGCTGGGGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCgg < 1:25792207/68‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCTGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa < 1:2054878/68‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGc < 1:12293539/67‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa < 1:5015557/68‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa > 1:19399698/1‑68 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa > 1:17336002/1‑68 (MQ=255) tgatAGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa < 1:6067662/68‑1 (MQ=255) atTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAAt > 1:10737341/1‑68 (MQ=255) gctgcttcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:9725207/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAAtttg < 1:12688407/68‑3 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:26988751/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:24905079/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:22971818/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:20387165/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:7019875/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:16716208/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:16131855/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:14979438/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg > 1:8605345/1‑68 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:1482669/68‑1 (MQ=255) tgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGt < 1:4715765/67‑1 (MQ=255) tgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGt < 1:18145993/67‑1 (MQ=255) tgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgg > 1:15642638/1‑68 (MQ=255) tgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgg < 1:14647898/68‑1 (MQ=255) | ACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGG > CP009273/3202549‑3202682 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |