| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3375198 = | 320 (0.890) | 30 (0.100) | 11/94 | NT | 10.6% | coding (1097/1368 nt) | degQ | serine endoprotease, periplasmic |
| ? | CP009273 | 3375228 = | 235 (0.780) | coding (1127/1368 nt) | degQ | serine endoprotease, periplasmic | |||||
Only 100 of 525 total aligned reads displayed.
GTAGAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGTC > CP009273/3375161‑3375295 | gTAGAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGa > 1:1177342/1‑68 (MQ=255) aaGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt > 1:666387/1‑68 (MQ=255) aaGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt > 1:1700212/1‑68 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAgg < 1:23994446/66‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:8189479/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:6268360/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:10945606/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:3292209/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:23782797/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:17684522/67‑1 (MQ=255) tttagctgaccatcgctcaacgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGTGc < 1:28333183‑M2/7‑1 (MQ=255) gTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGc > 1:9772085/1‑68 (MQ=255) ttagctgaccatcgctcaacgttgcaccttCCAGCGGTGAAATGGTCACGCCCGCGCTGGTAGGTGc < 1:9398514‑M1/37‑1 (MQ=255) tGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCa > 1:15636593/1‑68 (MQ=255) gACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCa > 1:8422131/1‑67 (MQ=255) gACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCa > 1:14905599/1‑67 (MQ=255) agctgaccatcgctcaacgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGTGCAAc < 1:4973624‑M2/10‑1 (MQ=255) agctgaccatcgctcaacgttccaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGTGCAAc < 1:8593352‑M2/10‑1 (MQ=255) gctgaccatcgctcatcgttgcaccttGCAGCGCGGAAATGATCACGCCAGCGCTGGATGGGGCAACg < 1:22099791‑M1/41‑1 (MQ=255) gctgaccatcgctcaacgttgcaccttCCAGCGGTGAAATGCTCGCGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACg < 1:5776898‑M1/41‑1 (MQ=255) cGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAAc < 1:16247305/67‑1 (MQ=255) cGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACg > 1:21330808/1‑68 (MQ=255) gCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGt < 1:12901820/68‑1 (MQ=255) gCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGt < 1:6510001/68‑1 (MQ=255) gCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGt < 1:25493037/68‑1 (MQ=255) gCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGt < 1:22906515/68‑1 (MQ=255) gCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGt < 1:1196254/68‑1 (MQ=255) gCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGt < 1:13326725/68‑1 (MQ=255) ctgaccatcgctcaacgttgcaccttCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCGGGAAGGTGCAACGt < 1:1806329‑M1/42‑1 (MQ=255) tgaccatcgctcaacgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGTGCAACg < 1:6117287‑M2/11‑1 (MQ=255) cTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGGCGTGATCATTTCAGCGCTGGAAGGTGCAACGtt > 1:14619960/1‑68 (MQ=21) aCCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:12504421/54‑1 (MQ=255) aCCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGa > 1:11373130/1‑68 (MQ=255) aCCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGa > 1:1064305/1‑68 (MQ=255) ccAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGAt > 1:11036326/1‑68 (MQ=255) ccAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGAt > 1:22249813/1‑68 (MQ=255) gctcaacgttgcaccttCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATg < 1:14164469‑M1/51‑1 (MQ=255) aGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATgg > 1:5312292/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:6927104/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGGGGCGCGATGGTc > 1:11620074/1‑68 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCa > 1:26345142/1‑68 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCa > 1:5505072/1‑68 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCa > 1:5539489/1‑68 (MQ=255) ccTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAg < 1:10016466/68‑1 (MQ=255) ccTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAg < 1:18712335/68‑1 (MQ=255) ccTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAg < 1:27923533/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:4897249/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:4400296/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:28852910/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:16488245/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:7812863/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGCGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:19350235/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACACCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:19199779/68‑1 (MQ=255) cgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:29445111‑M2/27‑1 (MQ=255) cgttgcacctaccagcgcgggcgtgatcatttcagcgctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:5798214‑M2/27‑1 (MQ=255) tctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCt < 1:29561285/68‑1 (MQ=255) gtcgGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAg > 1:11432774/1‑68 (MQ=255) gtcgGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAg > 1:10096328/1‑68 (MQ=255) ggCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATg > 1:20253756/1‑68 (MQ=255) 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GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:27049856‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:25918625‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:20746203‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:23232816‑M1/68‑1 (MQ=255) TGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAg > 1:7664496‑M1/1‑68 (MQ=255) GAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTTAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAgg > 1:4593042‑M1/1‑68 (MQ=255) GAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAgg > 1:8893035‑M1/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:15252093/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa < 1:13085116/68‑1 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa < 1:8021430/68‑1 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:13663686/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa < 1:16032450/68‑1 (MQ=255) tCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTaaa > 1:25047314/1‑68 (MQ=255) cGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATc < 1:3655851/68‑1 (MQ=255) gctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAg > 1:17272244‑M2/6‑68 (MQ=255) gctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAg > 1:18920837‑M2/6‑68 (MQ=255) gctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAg > 1:936496‑M2/6‑68 (MQ=255) gctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAg > 1:19557048‑M2/6‑68 (MQ=255) gctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGATTAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAg > 1:20102237‑M2/6‑68 (MQ=255) tgAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAATGTATTAAAATCGATGAAGTTg < 1:257858‑M2/66‑1 (MQ=255) 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aaGGGGCAACGTTGTGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGt < 1:27407006/67‑1 (MQ=255) | GTAGAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGTC > CP009273/3375161‑3375295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |