New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3613476 | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/100 | NT | 100% | coding (925/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
? | CP009273 | = 3613512 | 0 (0.000) | coding (961/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
ATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCG > CP009273/3613465‑3613579 | aTTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgg > 1:28243477‑M2/1‑48 (MQ=255) aTTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccg > 1:14537035‑M2/1‑48 (MQ=255) tGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcag < 1:1330480‑M2/67‑52 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat < 1:3957490‑M2/67‑62 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat < 1:11762726‑M2/67‑62 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagccagacggatgcc < 1:7317173‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagccagacggatgcc < 1:21736664‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:2854663‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:523460‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:3813496‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:3690597‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:3278887‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:3266849‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:3018336‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:28727012‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:28619022‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:24010514‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:28418307‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:25112014‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:26167886‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:27663600‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:666633‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:990497‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:9418805‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:8699856‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:8609029‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:7925611‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:765516‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:729276‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:6720975‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:4590879‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:621177‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:6182442‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:6155254‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:6062542‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:5940923‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:25978043‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:5016806‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:15089937‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:18738331‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:18581423‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:18278812‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:18223419‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:17350820‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:17116142‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:17001285‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:16312409‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:23713240‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:15035379‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:14280309‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:13418981‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:12777963‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:12585459‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:11751718‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:11048632‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:10422282‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:23759906‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:22704101‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:22353833‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:22078599‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:21646840‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:19072866‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:20873111‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:20690150‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:19538903‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:20290692‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat > 1:29452456‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat > 1:10373883‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat > 1:903268‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat > 1:22091987‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat > 1:28261920‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcggcagccacacggcagacagacggatgc > 1:28769907‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgagcgtcagccacacgtcagacacacggatgcc < 1:6531806‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccggggattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:18704178‑M2/1‑4 (MQ=255) gcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccg < 1:746143‑M2/68‑66 (MQ=255) gcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccg < 1:968717‑M2/68‑66 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgt < 1:28106191‑M2/68‑67 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgt < 1:3127730‑M2/68‑67 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgt < 1:21329740‑M2/68‑67 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgtt > 1:16133887‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgt > 1:18874594‑M2/1‑1 (MQ=255) | ATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCG > CP009273/3613465‑3613579 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |