| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4514659 = | 391 (1.090) | 3 (0.010) | 3/98 | NT | 0.96% | coding (169/906 nt) | yjhH | putative lyase/synthase |
| ? | CP009273 | 4514711 = | 276 (0.880) | coding (117/906 nt) | yjhH | putative lyase/synthase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 419 total aligned reads displayed.
CGAGTGCCATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGTTCCGTCAC > CP009273/4514644‑4514778 | cGAGTGCCATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCg > 1:25437795/1‑68 (MQ=255)cGAGTGCCATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCg > 1:24936418/1‑68 (MQ=255) gAGTGCCATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCg < 1:27604340/67‑1 (MQ=255) gCCATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGa > 1:25318064/1‑67 (MQ=255) gCCATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGa > 1:22036079/1‑67 (MQ=255) gCCATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGa > 1:13592824/1‑67 (MQ=255) gCCATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGAc < 1:9220090/68‑1 (MQ=255) cATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGAcc < 1:477298/67‑1 (MQ=255) cATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGAcc < 1:14340477/67‑1 (MQ=255) aTGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGAcccc < 1:3809867/68‑1 (MQ=255) aTGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGAcccc < 1:17767719/68‑1 (MQ=255) aTGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGAcccc < 1:8152013/68‑1 (MQ=255) tGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCt < 1:17398665/68‑1 (MQ=255) tGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCt < 1:18426316/68‑1 (MQ=255) tGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCt < 1:21213605/68‑1 (MQ=255) tGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCt < 1:24653625/68‑1 (MQ=255) tGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCt < 1:1280186/68‑1 (MQ=255) gcgcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCtt > 1:1036765/1‑68 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGCCCCCTtta > 1:25677659/1‑68 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCttt < 1:27388403/67‑1 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCttt < 1:28369837/67‑1 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCttt < 1:20591442/67‑1 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTtta > 1:13660048/1‑68 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTtta > 1:28265450/1‑68 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTtta > 1:17632918/1‑68 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTtta > 1:21716281/1‑68 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTtta > 1:6079117/1‑68 (MQ=255) gcTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCATCGACCCCttt < 1:4875277/67‑1 (MQ=255) gcTGGGCAGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAAAAGCCCGTCGACCCCGtta > 1:7345852/1‑68 (MQ=255) GCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACCGCCCGTCGCCCCCTTTAGTaa < 1:4328597‑M1/67‑1 (MQ=255) GCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTaa < 1:10575396‑M1/67‑1 (MQ=255) GCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTaa < 1:17876926‑M1/67‑1 (MQ=255) GCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTaa < 1:22293007‑M1/67‑1 (MQ=255) GCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTaa < 1:20201340‑M1/67‑1 (MQ=255) GCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCGTTATTaa < 1:26470713‑M1/67‑1 (MQ=255) CTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAAt > 1:26089598‑M1/1‑67 (MQ=255) TGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCa < 1:14932249‑M1/68‑1 (MQ=255) TGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCGTTATTAATCa < 1:9017225‑M1/68‑1 (MQ=255) aTTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGa > 1:11534845/1‑68 (MQ=255) aTTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGa > 1:10044805/1‑68 (MQ=255) tCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACGCAGATAAAACAGCCCGTCGAACCCTTTATTAATCAGGAAg > 1:18638059/1‑68 (MQ=255) tCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAg > 1:12351404/1‑68 (MQ=255) tCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAg > 1:21003855/1‑68 (MQ=255) tCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAg > 1:11265822/1‑68 (MQ=255) aTTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTc > 1:16754502/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCAGCGGGACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg < 1:15360147/68‑1 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGCCCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:1954477/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:26901143/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:6619898/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:6433765/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:23156681/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:7910293/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:23493651/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:23794537/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:28784207/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:10623147/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:13088572/1‑68 (MQ=255) tttGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTAGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCg > 1:4191943/1‑68 (MQ=255) cTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCa > 1:22078130/1‑66 (MQ=255) tAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACt < 1:6764285/68‑1 (MQ=255) ttCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTcgc > 1:26727383/1‑68 (MQ=255) tCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTcgcg < 1:1614346/68‑1 (MQ=255) ccaccGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCAt > 1:18072116/1‑68 (MQ=255) accGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCAtt > 1:1903014/1‑67 (MQ=255) accGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCAtt > 1:1475130/1‑67 (MQ=255) accGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCAtt > 1:24498931/1‑67 (MQ=255) ccGGTACCCAGATAAATCTGCCCGTCTTCGGCTTTATTAATCAGGAAGTCGGATACTTCGCGCATTGc < 1:8708094/68‑1 (MQ=255) cGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGcc < 1:1173262/68‑1 (MQ=255) cGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGcc < 1:1570822/68‑1 (MQ=255) ggTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCt < 1:17141215/68‑1 (MQ=255) aCCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCtttt < 1:14156550/68‑1 (MQ=255) ccAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTa > 1:8492896/1‑68 (MQ=255) ccAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTa > 1:9388868/1‑68 (MQ=255) ccAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTa > 1:10224007/1‑68 (MQ=255) ccAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTa < 1:5146995/68‑1 (MQ=255) ccAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTa > 1:3922202/1‑68 (MQ=255) ccAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTa > 1:3401002/1‑68 (MQ=255) gATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCa > 1:9578266/1‑68 (MQ=255) tAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAg > 1:29277824/1‑68 (MQ=255) aaaCAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAggg < 1:22938058/68‑1 (MQ=255) aaCAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:28597827/1‑68 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:29783176‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:9808342‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:10973867‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:19301316‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:1979761‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:773659‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:21329518‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:22566163‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:23440548‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:2425737‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:27091203‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGt > 1:27230813‑M2/8‑67 (MQ=255) acagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGAAACTTCGCGCATTGCCATTATATCAAGGGt > 1:22405575‑M2/8‑67 (MQ=255) cagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGtt > 1:20707137‑M2/7‑67 (MQ=255) cagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGtt > 1:16905152‑M2/7‑67 (MQ=255) cagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGtt > 1:13449935‑M2/7‑67 (MQ=255) cagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGtt > 1:12088822‑M2/7‑67 (MQ=255) cagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGtt > 1:4555086‑M2/7‑67 (MQ=255) cagcccGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGtt > 1:29545248‑M2/7‑67 (MQ=255) | CGAGTGCCATGCGCTGGGCTGTATTCATTTGGCTAAATTCACCACCGGTACCCAGATAAAACAGCCCGTCGACCCCTTTATTAATCAGGAAGTCGGCAACTTCGCGCATTGCCTTTTTATCAAGGGTTCCGTCAC > CP009273/4514644‑4514778 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |