| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 64557 | 398 (0.840) | 35 (0.090) | 12/94 | NT | 8.6% | coding (1224/2352 nt) | polB | DNA polymerase II |
| ? | CP009273 | = 64577 | 412 (1.040) | coding (1204/2352 nt) | polB | DNA polymerase II | |||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
AATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/64482‑64557‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agccctggcGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT < CP009273/64577‑64511 ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:2588537/68‑1 ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:13553775/68‑1 ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:16526282/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAc > 1:22062878/1‑66 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:5961/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:26103093/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:24285430/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:34556180/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGCTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:6784797/1‑67 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC < 1:5217351/68‑1 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC < 1:13401292/68‑1 AGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC > 1:1604480/1‑66 AAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:9540182/1‑68 AAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:25776798/1‑68 AAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:15775632/1‑68 aatGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:29811075/65‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTTTAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:31915961/1‑67 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:28195063/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:628880/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:20584460/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:16435253/1‑67 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:17687094/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:24111066/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:28731889/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:21679674/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:33414128/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:20996054/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:4649189/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:18599273/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:8504998/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:17003679/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:8799428/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:35270859/1‑67 GGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC > 1:10598203/1‑62 GGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGGGACGTGATGGATTg > 1:38850128/1‑66 GCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGGATCATAAAGCCCTGGCGGCTTCGTGATGGGTTCACGGCCAG > 1:21072673/1‑68 CTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGG > 1:17378018/1‑68 AGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGCTTCACGGCCAGGGGTTTAg > 1:27394671/1‑67 ACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGT > 1:19103810/1‑68 ACCAGCACTGAATCATAAAGCCCGGGCGGCTACGTGATGGATTAACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGT > 1:4956011/1‑68 GCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTG > 1:10191270/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:35923055/1‑68 ACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGT > 1:21790891/1‑68 ACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGT > 1:29501874/1‑68 TGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGT > 1:28920776/1‑66 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:34937675/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:33763442/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:32845993/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:25362229/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:5739467/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:27250352/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:8885720/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:31293651/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:7261453/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTGTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGCCTAT > 1:37789219/1‑68 AGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:26874829/1‑68 AGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:13102252/1‑68 GCCCTGGCGGCTGCGTGATGGATTCCCGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:6168627/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:7635187/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:14470680/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:18336081/1‑68 CCTTGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:24912930/68‑1 CCTGTCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:17584379/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:20027407/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:4445637/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:17319108/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:36776529/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:8024754/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:16633788/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:7806512/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:20166837/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:23386801/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:34175013/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:24633762/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:26429859/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:30702356/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:14715876/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:15209826/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:9184557/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:7020659/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:22554988/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:29942110/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:38682080/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:3950044/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGA > 1:29146171/1‑59 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTAGTGCTGGACTATAAAAG < 1:6924087/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:2307206/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:315597/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:12671451/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:23803558/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:21354331/68‑1 TGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCC < 1:17871975/68‑1 GGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCT < 1:12231807/68‑1 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:11147860/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:32088972/1‑64 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |