| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4306574 = | 188 (0.400) | 13 (0.030) | 11/98 | NT | 7.9% | coding (462/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase |
| ? | CP009273 | 4306632 = | 137 (0.330) | coding (404/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase | |||||
ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306644‑4306574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT > CP009273/4306632‑4306696 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:10827437/68‑1ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCA > 1:1201438/1‑67ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCA > 1:20608012/1‑67 CCGTCTGCATCTGCGGTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:12301710/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:11392234/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:9475578/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:7356606/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:1960631/68‑1 CCGTCAGCATCTGCGCTGCTAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:2736052/68‑1 CGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCG < 1:13955973/68‑1 GTCTGCATCTGCGCTGCGCACTGCCGCATCACCCCACGCTGCAGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC > 1:23460843/1‑68 TCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCCCGCTGCCGCGGTTTGAAAAACTGGTGCCGCGC > 1:5583017/1‑67 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAACACTGGTGCAGCGCAGA < 1:14692067/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:13346520/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:4106800/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:38692178/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:36349054/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:5572825/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:18558446/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:12055899/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:17227114/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:30019395/68‑1 TCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCA > 1:6235598/1‑68 CTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAG < 1:21338180/68‑1 CGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCGGCTGTTTGATAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACG > 1:28814536/1‑68 GCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGG > 1:4588916/1‑68 GCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGG > 1:25205457/1‑68 TGCGAACTGCCGCATCACCCCCCGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGT < 1:24092018/67‑1 TGCGAACTGCCGCATCACACCCCGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGGGCAGCGCAGATGCAGACGGT < 1:3596115/67‑1 GAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTC > 1:32588892/1‑68 ATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTG > 1:27708952/1‑68 CACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGAC > 1:27962248/1‑68 ACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCG > 1:31104325/1‑68 GCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:7980055/1‑68 CGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGC > 1:23653043/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:26215814/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:22308079/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:35723667/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:3102698/1‑68 AGCGCTGATGCAGACGGTGCTGGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:21642487/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATC > 1:8584934/1‑68 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATC > 1:31503263/1‑68 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:11803977/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:24808421/67‑1 GCGCAGATTCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:3213084/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:35287929/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:14258027/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:1538069/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:1323044/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:38975373/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:35332089/1‑68 CGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:27707435/1‑67 CGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:13208866/1‑67 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:3811851/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:22731215/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:21948466/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:29619577/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:38236080/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:36937294/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:27882147/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:1794470/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:7748957/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:13567691/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGGCTCTTCGATGGCGTTGATCA < 1:27938769/66‑1 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306644‑4306574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT > CP009273/4306632‑4306696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |