| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4501871 = | 310 (0.660) | 23 (0.060) | 12/92 | NT | 5.8% | coding (361/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit |
| ? | CP009273 | 4501966 = | 495 (1.280) | coding (266/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4501947‑4501871‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > CP009273/4501966‑4502031 CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:5462247/1‑68CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:11058631/1‑68CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:1224351/1‑68CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:34895230/1‑68CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:27476589/1‑68CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:8141504/1‑68CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTAAGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:28172625/1‑68 TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGG < 1:20382921/68‑1 TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:10405501/1‑67 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:36637102/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:5184194/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:1729673/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:38084899/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:35048975/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:11319463/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:2872438/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:8913861/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:1140000/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG > 1:2043875/1‑67 GGGGTCTCTCCTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:28355707/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCA > 1:27829807/1‑68 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:20373723/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:20841746/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:19064122/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:35335545/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:6150264/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:38673399/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:1560198/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:12873874/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:28901759/67‑1 GGGGGCGCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGGGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:22207824/67‑1 GGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT > 1:18254367/1‑68 GGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT > 1:1541985/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:35257511/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:2192580/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:31021745/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT < 1:16662977/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:36085816/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:29516264/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:32011788/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:10239118/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:892111/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:33655292/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:1345371/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:34230569/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:14707105/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:16439213/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:25401436/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:25214539/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:24256942/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:19037174/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:16676059/1‑67 cCTCTACTTCTTATGCCCTCTCTGCCCGGGATCGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:29240676/66‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:26905788/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:37417725/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:29050054/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:10425214/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:32881120/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:33855406/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:22305061/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:13792336/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGAGCTGCCGCTGCTGGCCGTTGCGGGCGGCATGG < 1:3559199/67‑1 GCTCTACTTCTTAAGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:14839042/67‑1 ACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:57512/68‑1 ACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:8936723/68‑1 ACTTCTTATGCCGGCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:5162685/68‑1 ACTTCTACTGCCGCCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTAGCGGGCGGCATTGTTAACA < 1:27932879/68‑1 CTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGA < 1:6650848/68‑1 TTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAG < 1:32101904/68‑1 TTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAG < 1:13931111/68‑1 TATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGA < 1:4528384/68‑1 TATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCGGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGA < 1:17829977/68‑1 ATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAA < 1:16121808/68‑1 cGCCGTCACTGCCCGTCATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTAGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAAT < 1:29479328/67‑1 GCCGTCACTGCCCGGGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATA < 1:30366458/68‑1 CACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGG < 1:10240078/68‑1 CACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGG < 1:28342447/68‑1 CACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCG < 1:19773909/67‑1 GCCCGGGATGGGGCGGCCGCTGCGGCCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAT < 1:21568245/68‑1 CCCGGGATGGTGCTGCCGCTGCGGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTAAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:26140797/68‑1 CCCCTGATGGTGCAGCCGCTGCGGGCCTTAGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:18953226/68‑1 CCGTGATGGTGCGGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:21704517/67‑1 CCGGGAGGGTGCTGCCGCGGCGGGCCTTGGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGC < 1:38351612/68‑1 cggGATGGTGCTGCCGCTGCGGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:21045028/65‑1 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAC > 1:33137341/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:38408115/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG < 1:17898592/67‑1 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:6114425/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:28344042/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:7880461/1‑67 ATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCC < 1:13532865/67‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGC < 1:18294048/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGC < 1:28447623/68‑1 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > 1:2091477/1‑68 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC < 1:30197467/68‑1 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC < 1:10676739/68‑1 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC < 1:6373014/68‑1 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > 1:27319588/1‑68 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGT < 1:2056931/52‑1 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCG < 1:16496401/39‑1 CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4501947‑4501871‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > CP009273/4501966‑4502031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |