| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4501871 = | 310 (0.660) | 23 (0.060) | 12/92 | NT | 5.8% | coding (361/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit |
| ? | CP009273 | 4501966 = | 495 (1.280) | coding (266/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit | |||||
Only 100 of 590 total aligned reads displayed.
ACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501903‑4502033 | aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac > 1:1003578/1‑68 (MQ=255)aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac < 1:3907840/68‑1 (MQ=255)aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac > 1:5995408/1‑68 (MQ=255)aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac < 1:13264600/68‑1 (MQ=255)aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac > 1:28322417/1‑68 (MQ=255)aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACACAGGCCAGGCTCGCGGCATGCTTAac > 1:29610445/1‑68 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:5135973/68‑1 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:29178638/68‑1 (MQ=255) acttcttatgccgtcactgcccgtgatggtgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAaca < 1:57512‑M2/6‑1 (MQ=255) acttcttatgccgtcactgcccgtgatggtgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAaca < 1:8936723‑M2/6‑1 (MQ=255) tCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:8769921/65‑1 (MQ=255) cACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCga < 1:34553638/68‑1 (MQ=255) aCGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCgag < 1:19877747/68‑1 (MQ=255) cGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCgaga < 1:35185177/68‑1 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa < 1:25835978/68‑1 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa > 1:3749372/1‑68 (MQ=255) gggCAGGGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa < 1:7683696/68‑1 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:10970361/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:14472451/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAat < 1:2166086/67‑1 (MQ=255) cAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata < 1:1833347/67‑1 (MQ=255) aGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAatat < 1:23313436/67‑1 (MQ=255) aGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAatat < 1:24531025/67‑1 (MQ=255) aGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAatat > 1:14032687/1‑67 (MQ=255) aCGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGt > 1:13544855/1‑68 (MQ=255) ggCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGa > 1:16004543/1‑68 (MQ=255) cccgggatggtgctgccgctgcgggcctttgcgggcggcatggTAAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:26140797‑M2/25‑1 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt > 1:8556832/1‑67 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt < 1:16209665/67‑1 (MQ=255) aTAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:22663539/67‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:7098849/68‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:24860904/68‑1 (MQ=255) agaagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCag < 1:15616884/68‑1 (MQ=255) aagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGATTATCCGGTGATGCCagag > 1:33007024/1‑68 (MQ=255) aagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCagag > 1:21234708/1‑68 (MQ=255) aagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCagag > 1:30864717/1‑68 (MQ=255) agTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAgg < 1:9272725/68‑1 (MQ=255) agTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAgg < 1:30426410/68‑1 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:12797543/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:11352818/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:20885884/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:6217465/1‑68 (MQ=255) tacagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTAAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:11830724/65‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:26485336/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:20128381/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:4569804/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:16676737/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:10226559/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:26960019/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:8236574/67‑1 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:38542075/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:17252346/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATACGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:1242759/1‑68 (MQ=255) gCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:33933483/1‑67 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc > 1:15152580/1‑67 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGca < 1:4164225/68‑1 (MQ=255) cccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGcac < 1:9555956/68‑1 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt < 1:6376529/68‑1 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt < 1:6798832/68‑1 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAAAATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt < 1:5334751/68‑1 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:28483237/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:25590635/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:22999602/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:23655542/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:36643396/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:34820840/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:17403013/1‑67 (MQ=255) gagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:37104946/1‑67 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:30022734/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:27670604/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:4902031/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:7931177/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:19231945/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:3545811/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:19639339/1‑65 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:31985405/1‑65 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:25255287/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:218898/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:38235687/1‑65 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:2943687/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:14904865/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:14659871/65‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt > 1:24418812/1‑68 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:10548103/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:28754341/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:31242764/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:34444212/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:32330268/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTa < 1:13724508/68‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACAGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:3991365/67‑1 (MQ=255) gCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:37892303/1‑68 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:22138332/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:27939053/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa < 1:36232558/67‑1 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:23896322/1‑67 (MQ=255) cggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAc > 1:33137341‑M2/9‑67 (MQ=255) ggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcg < 1:17898592‑M2/60‑1 (MQ=255) tGGTTAACACCGAGAATATGCGGTGATGCAAGAGGTTTTCGCACAATCGCCTGTATCAGCAcgcccgc < 1:17757204/68‑1 (MQ=255) ggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccgcc > 1:27319588‑M2/3‑68 (MQ=255) gTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:2056931‑M2/51‑1 (MQ=255) | ACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501903‑4502033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |