| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4506708 = | 378 (0.800) | 35 (0.090) | 12/94 | NT | 10.7% | coding (827/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
| ? | CP009273 | 4506742 = | 267 (0.670) | coding (793/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4506782‑4506708‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > CP009273/4506742‑4506807 TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCG < 1:19562380/68‑1TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCC < 1:11908488/67‑1 AAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGC < 1:20605404/68‑1 AAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGC < 1:6249456/68‑1 AAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGC < 1:25144195/68‑1 AAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGC < 1:2942524/68‑1 AAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCG > 1:26559411/1‑67 AACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:9847910/68‑1 AACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:22694017/68‑1 AACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:30907696/68‑1 AACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:4166500/68‑1 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:25671404/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:22292326/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:20801015/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:12393486/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:23577619/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:25000616/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:28493669/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:29084776/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:39078483/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:31314624/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:33099864/1‑68 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT > 1:12784633/1‑68 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:27412651/1‑68 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:36873856/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:4440044/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:246540/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:23421484/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:6435828/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:32448558/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:10416442/68‑1 CGCTGGGAGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:6371572/68‑1 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCG < 1:28744299/68‑1 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCG < 1:28362292/68‑1 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC < 1:36367284/67‑1 GGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGATCCCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCCCCGTTGCGG < 1:3401968/68‑1 GGGGGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGG < 1:24251527/68‑1 GGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACG < 1:5902339/67‑1 GGTGATACCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACG < 1:38629894/67‑1 ttATAGCCACGCTAACCCGCTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGG < 1:14551894/65‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |