| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4506708 = | 378 (0.800) | 35 (0.090) | 12/94 | NT | 10.7% | coding (827/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
| ? | CP009273 | 4506742 = | 267 (0.670) | coding (793/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator | |||||
Only 100 of 572 total aligned reads displayed.
TTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTC > CP009273/4506675‑4506809 | tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:36235694/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:37961092/1‑68 (MQ=255) gtgaggtgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgggcTCGCAGCGCCGCACGCCGGTGCGGTa < 1:18603928‑M1/26‑1 (MQ=255) aGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTa > 1:28591033/1‑68 (MQ=255) gggAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTa < 1:14888087/65‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:29550229/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:10134286/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:18152081/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:17855906/67‑1 (MQ=255) tgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACgg < 1:22277445‑M2/8‑1 (MQ=255) tgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACgg < 1:37344916‑M2/8‑1 (MQ=255) tgatagccaccctaacccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCCCGCCGTTGCGGGAAcgggg < 1:17102322‑M1/44‑2 (MQ=255) aaCGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACggg < 1:31337049/67‑1 (MQ=255) aaCGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACggg < 1:18277449/67‑1 (MQ=255) tCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGc > 1:13734165/1‑68 (MQ=255) tCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGGTGCGGTAACGGGTTAGc > 1:36610243/1‑68 (MQ=255) cgccccgctaacccgttaccgcaccggcgtgctgcgcggcgagccCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGc < 1:22850923‑M2/23‑1 (MQ=255) gccacgctaacccgttaccGCACCGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTGGCGGTAACGGGTTAGCg < 1:35051004‑M1/49‑1 (MQ=255) gccacgctaacccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg < 1:6009045‑M1/49‑1 (MQ=255) gccacgctaacccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg < 1:28101000‑M1/49‑1 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg > 1:12331917/1‑68 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATAGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGc < 1:6282402/67‑1 (MQ=255) gCTCAGGTGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:15431751/68‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:24959327/68‑1 (MQ=255) cgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:31084938‑M2/19‑1 (MQ=255) cTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGGTAGCGTg > 1:26771232/1‑66 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:38659847/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:11719723/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:29864814/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:4339429/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:13965564/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:1524497/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCt > 1:18811754/1‑68 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCt > 1:30510474/1‑68 (MQ=255) ctaacccgttaccgcaacggcgggcTCGCCGCGCAGCACGCCGTTGGGGGAACGGGGTTGCGTGGCTa < 1:4969326‑M1/43‑1 (MQ=255) ggCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAt > 1:25092656/1‑67 (MQ=255) aacccgttaccgcaacggcgggctgcgctgcgaccccgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtc < 1:2173177‑M2/23‑1 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:13114715/1‑67 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:22643372/67‑1 (MQ=255) cccgttaccGCACCGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:14259608‑M1/58‑1 (MQ=255) cccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAGCGGGTTAGCGTGGCtataa < 1:14551894‑M1/58‑3 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcac < 1:26339486/67‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcac < 1:1761563/67‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:29206365/1‑66 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:35633505/1‑66 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:17409525/1‑66 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:23665811/1‑66 (MQ=255) ccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:29077361‑M1/58‑1 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:240917/1‑67 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:32321964/1‑67 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:16348362/1‑67 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:27267850/1‑67 (MQ=255) ccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctcacc < 1:34463539/68‑1 (MQ=255) ccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctcacc < 1:19712320/68‑1 (MQ=255) ccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctcac > 1:39093065/1‑67 (MQ=255) cGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCa < 1:28362292‑M1/67‑1 (MQ=255) AACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCCCCCAGCg < 1:33528406‑M1/68‑1 (MQ=255) AACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGc > 1:2452392‑M1/1‑67 (MQ=255) AACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCg > 1:38550172‑M1/1‑68 (MQ=255) 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ggTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGAGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTc > 1:13498508/1‑68 (MQ=255) | TTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTC > CP009273/4506675‑4506809 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |