New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4512275 = | 416 (0.880) | 32 (0.080) | 15/92 | NT | 7.7% | coding (1637/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
? | CP009273 | 4512318 = | 427 (1.100) | coding (1594/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4512351‑4512275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgcatcggTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCTT > CP009273/4512318‑4512383 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:748649/1‑68 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:23641954/68‑1 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:17182801/68‑1 TCTGGCATAAGGTCAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGGTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:6479538/68‑1 CTGTCTTACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:30010500/68‑1 CTGTCATACGGTACGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:32123166/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:10831602/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:26642980/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:5754960/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:13235328/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:37446333/1‑68 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:18203370/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:19699879/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:24467643/1‑68 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:33161372/1‑67 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:18145183/1‑67 CATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC < 1:19845004/68‑1 CATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC > 1:21043575/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:24799740/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:5372644/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:3304524/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:22765137/1‑68 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGa < 1:39129642/68‑2 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:20115746/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:38184287/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:37724119/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:37125989/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:35814014/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:27649786/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:28799634/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:18602434/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:38920800/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:14927915/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:30485668/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:29258787/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:6057778/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:4897537/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:36699008/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:14780695/1‑67 GGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGGGCATCGGTGA < 1:5021825/68‑1 ATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGA < 1:16662571/68‑1 aTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:12311290/67‑1 aTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:12830310/67‑1 TTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTGGCTACTGGCGCGGGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:12357323/68‑1 TCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACAT < 1:9664791/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:23534303/68‑1 GTTCATCACCGAAGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGC < 1:32066889/68‑1 GTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:27847594/67‑1 GTTAATCACCGACGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGC < 1:5962505/68‑1 TAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCT < 1:33781733/67‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:9260706/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:14342396/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:36276131/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCCGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:22034595/68‑1 ACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTATCTACGGGCGCCTGCATCGTTGATAAACGAAACATGCTTACCGT < 1:19286930/68‑1 GATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATG < 1:27231807/68‑1 TGCACGTTGCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGAC < 1:24890198/68‑1 ACGTTTCTCGGGCGATTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAG < 1:27483102/67‑1 GTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATG < 1:33999209/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:25600688/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:12652168/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGGGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:15881191/68‑1 tcgCGGGCGTTGCTACTGGCGCGGGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:24616295/64‑1 aTCTACTCGCCCGTGCACCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACT < 1:8598314/66‑1 TACTGCCGCGTCCATCGGTGATAAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTA < 1:34759412/68‑1 TACGGGCGCGTGCTTCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTA < 1:4130341/68‑1 gGGCTCGTCCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCGTCAGGGCACTGGTAACC < 1:37236192/67‑1 tCGTGCACCGCTTATAAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGG < 1:10267841/66‑1 CGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTA > 1:4392925/1‑68 CGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTA > 1:23857521/1‑68 GTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAG > 1:32270390/1‑68 TGCATCGGTGATTAAGGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:10380579/68‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGT < 1:20730898/68‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |