| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 725724 | NA (NA) | 36 (0.090) | 17/94 | NT | NA | coding (686/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | = 725738 | NA (NA) | coding (700/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 364 total aligned reads displayed.
CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725649‑725724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccggtgaTTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA < CP009273/725738‑725673 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:29174689/68‑1CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:26627600/68‑1 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGCCGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:30616847/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:31517932/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:30898500/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:24307918/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCCCTTCGGGCGCACACAGCCGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:13204359/1‑67 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:8248654/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:19539428/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:5935473/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:22177422/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:25207324/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:440230/68‑1 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:28611614/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:2495600/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:10726345/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:5759526/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:36305297/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:37245025/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:18200807/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:18701458/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:5100971/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:6547412/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:12843370/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:25253100/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:34884953/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:34316845/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:33940463/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:27387259/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:14883404/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:31039460/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:34175197/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:19296583/67‑1 ACCGCGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:38955995/67‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:22937860/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:16311716/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:24975071/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:8456909/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:21120914/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:25993626/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:2703021/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGCTGA < 1:32280494/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACCTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:28163349/1‑68 CGGGGACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:1921854/68‑1 GTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGcat > 1:38035693/1‑64 GTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTATGGCGCACACAGACCTTCAACCGCGAAGCCGCCGTTGgat > 1:33793973/1‑64 TGACCGGGCTGGTGGACCGCCTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCC < 1:6726827/68‑1 CCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGC < 1:8822546/67‑1 CCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGC < 1:394061/67‑1 CCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGC < 1:34969401/67‑1 ACGTTCCACCGCGGAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGCACG > 1:17063598/1‑65 ACGTTCCACCGCGCAGCCGCCGGGGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGGGTCGCGGTGGGACG > 1:27528098/1‑65 ACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGCTTTCGCCGCGGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGGACG > 1:15818310/1‑65 ACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCGGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACG > 1:16842676/1‑65 ACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGC > 1:38822342/1‑67 GCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCC > 1:31863346/1‑68 GCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGAGGTGGAACGTCTGTGTTCGCCC > 1:26303648/1‑68 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:35223630/1‑68 GCCGTTGATTGCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:22608969/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:6874897/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:26878410/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:22033141/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:23642519/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:5376225/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:33657592/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:33130232/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:32754105/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:16117432/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:11711223/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:11866116/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:12271609/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:4706779/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:5246056/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:10518630/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:5551361/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:28352560/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:8147202/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:35673133/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:15179012/1‑67 CCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCCCCGGCGGCTTCGCGGTGGATCGTCGGTGTGCGCCCGAAGCGGT > 1:13604294/1‑67 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:9530237/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:34536194/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:29425132/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:26439221/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:9042330/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:24572308/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:22522945/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:21598349/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:11265682/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:6195352/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:17557065/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTC < 1:5706498/67‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGGGGAACGGCTGGGTGCGCCCGAAGCGGTC < 1:20616880/67‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:7634406/68‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:36855653/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |