| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2279605 = | 429 (0.910) | 31 (0.090) | 12/86 | NT | 9.4% | coding (1751/1761 nt) | yejM | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor |
| ? | CP009273 | 2279638 = | 265 (0.730) | intergenic (+23/‑52) | yejM/proL | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor/tRNA‑Pro | |||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2279683‑2279605‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatcagttagcgaAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCA > CP009273/2279638‑2279703 GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:28817664/1‑68GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:19254085/1‑68 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:14202624/1‑67 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATC > 1:22416540/1‑68 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATC > 1:33644364/1‑68 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATC > 1:4370248/1‑68 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAAT < 1:26171599/67‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |