| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2691481 | 473 (1.000) | 43 (0.100) | 16/100 | NT | 8.7% | coding (429/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound |
| ? | CP009273 | = 2691501 | 479 (1.140) | coding (409/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2691410‑2691481‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggctgCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGTT < CP009273/2691501‑2691435 TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:4001489/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:19860423/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:11708827/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:27503716/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:5399810/1‑68 GTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGG < 1:34136835/68‑1 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCACCCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:13553042/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGC > 1:37135710/1‑68 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:32767640/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:15590576/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:29290803/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:3198084/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:4550608/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:16892911/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:35342670/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:34761938/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:20129722/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:37303091/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:13796555/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:12242380/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:7816862/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:7852703/1‑66 GCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:23393015/1‑65 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:18107671/1‑67 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:28786481/1‑67 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:33150944/1‑67 CATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGgt > 1:3828358/1‑66 GCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGC < 1:1444451/68‑1 TCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGCATTTGGCTGGCGCGGGGTAGTCTTTTCGGCAGCCAA > 1:26567472/1‑68 GTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAAT > 1:10090939/1‑68 GTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTAATCTGATCGCCAGCCAAAT > 1:33485630/1‑68 TCAATACCCAACCACCATAGCCCCGCTGAATTTGGGTGCCGCGGGTTTATCTTATAGCCCGCCAAATT > 1:9563295/1‑68 TCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGGTGGCGCGGGTTAATCTTTTCGCCAGCCAAAT > 1:5418730/1‑67 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGg > 1:27028121/1‑67 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:1755750/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:16818917/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATAGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:13551631/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:12870337/1‑68 CCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTA > 1:35676457/1‑68 ATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATGTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGGGGCGATGGTG > 1:13218580/1‑68 AGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGT > 1:20133902/1‑68 GCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTT > 1:34341582/1‑68 GCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTT > 1:3672226/1‑68 GCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTT > 1:27430271/1‑68 GCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTT > 1:14260172/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCGATGGTGGTTG > 1:25862801/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTTTGGTGGTTGG > 1:17440969/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:18223333/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:32664348/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:25565153/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:7402049/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:476828/1‑68 GCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCCGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTA > 1:6084298/1‑68 GCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTAAGCGTGGCGATGGTGGTTGGGTA > 1:8326782/1‑68 ATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGAC > 1:34068275/1‑68 ATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGAC > 1:5753039/1‑68 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGTCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:15970890/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:28937353/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:30070208/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:31295903/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:18890540/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGCGGTTGGGTATTGACGATG < 1:1650384/68‑1 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAACTTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:26175899/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGCCGATGC > 1:19103278/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:13936194/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:13007082/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:15481809/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:26070225/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:10674406/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:20347122/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:25083671/1‑68 GCTGCCGCGGGGTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGGTGGGTATTGACGATGC > 1:9562267/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGGGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:30425785/1‑68 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CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:391792/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:30273707/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:16031781/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:36421804/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:31153662/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:17431323/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:34808679/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:21554444/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:15255756/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTAGTGACGATGCG > 1:14860119/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTTGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT < 1:22333276/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |