| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 332 (0.700) | 66 (0.190) | 23/84 | NT | 22.2% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 214 (0.600) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630134‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAG > 1:2562924/1‑67 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA < 1:11660794/67‑1 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA > 1:27979343/1‑67 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA > 1:24601474/1‑67 CCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCC < 1:18340922/68‑1 GCCACGCCCTCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:23808159/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCCGACCCGC > 1:9209418/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:23024211/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:36897480/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:6096943/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:17400674/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:24130891/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:13368071/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:4680391/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:32369166/68‑1 CACGGCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGCGCAACGGTTTATGGAGAGTGAATCGCACCCGACCCGCGg > 1:3120938/1‑67 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:38025593/1‑68 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:17032758/1‑68 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC > 1:35863434/1‑68 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGT < 1:12407775/67‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:15277101/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:34461076/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTGCGAGCAACGGGTTATGCAGAGTGAATGGCCCCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:36263346/68‑1 ACCTGTAACTCTTCTAGCAACGGTTTATGCAGAGTTAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:24636696/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGCATGAATGGCACCCGACCCCCGCGGGTCTGGTGC < 1:8724818/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA > 1:6930416/1‑68 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:28900620/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:33324640/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:37736474/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:37822634/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:20025457/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:10347277/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:11125987/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:13233910/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:15560667/66‑1 ACCTGAAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:4594361/66‑1 TAACGCTTCGACCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:3441379/68‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCcc > 1:5187751/1‑65 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:38574730/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:7329063/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATCCCGCGTGACTGCCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:16190736/67‑1 ACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC > 1:37087759/1‑66 tcaTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTG < 1:11701602/65‑1 TCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGCCCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTG < 1:26316758/68‑1 TCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTG > 1:835316/1‑68 TCTTCGAACAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCT > 1:32867452/1‑67 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:18061077/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:35678456/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:37733844/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:29301334/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:32915991/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTGACTCTGCA > 1:4128606/1‑68 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCA > 1:37008111/1‑68 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCA < 1:19007080/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGGCGGGTGCCCTTCACTCTGCA > 1:35122967/1‑68 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGGGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCA < 1:8605199/68‑1 TTCGAGCAACGGTTAATGCAGCGTGAAGGGCACCCGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCA < 1:2072754/68‑1 TCGAGCAACGGTTAATGCAGAGGGAACGCCACCACACCCGCGCGGGGCTGGTGCCATTCACTCTGCAT < 1:16125706/68‑1 TTATGCAGCGGTAATGGCCCCAGCCCCCCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCT < 1:19440528/67‑1 TTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCT < 1:35403236/67‑1 TGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGGTCGAA > 1:16867469/1‑68 TGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAA > 1:9912823/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:1687237/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:18392862/1‑68 CAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGGGGGTGTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA > 1:4137447/1‑68 CAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA > 1:6204150/1‑68 GTGAATGGCACCCGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGT < 1:38798371/66‑1 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGGCATTCACGCTGGGTAAACCGTTGGGCGAAGAGTg > 1:18085747/1‑66 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:36156652/1‑67 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAG < 1:11018493/65‑1 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCAGGCACTCTGCATTCACCGTTGCTCGTTGAGTT > 1:33726103/1‑67 AATGCCACCAGCCCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAG < 1:7889269/68‑1 ATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAG < 1:7441343/67‑1 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGGTGGAAGAGTTACAGGT > 1:3688560/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:5224355/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTAAAGGT > 1:4677870/1‑68 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCTGAAACCGTGGCGCGAAGAGTGACAGGTGC > 1:33379107/1‑68 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:11715993/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:24581278/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:18501187/1‑66 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:29955794/1‑68 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:26630791/1‑68 GACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:19714280/1‑68 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:14398275/1‑67 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:24788415/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:16087461/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:7253372/1‑68 CGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGT > 1:26538908/1‑68 CGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGT > 1:20064807/1‑68 CGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGT > 1:1687725/1‑68 cccCGGGTCGGGTGCCATTCACTCGGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTG < 1:33480291/65‑1 CGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT < 1:19654974/54‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:19277152/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:2097881/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGG < 1:24259089/67‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGG < 1:25147671/67‑1 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:6326737/1‑67 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:13677141/1‑67 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < 1:17205194/68‑1 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGC < 1:25858846/67‑1 GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630134‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |