| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 332 (0.700) | 66 (0.190) | 23/84 | NT | 22.2% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 214 (0.600) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 451 total aligned reads displayed.
AGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGACGC > CP009273/3630132‑3630266 | aGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCa > 1:16725719/1‑68 (MQ=255)aGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCa > 1:3757344/1‑68 (MQ=255) ggCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAg < 1:17205194‑M2/68‑2 (MQ=255) gCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAg < 1:25858846‑M2/67‑2 (MQ=255) gCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgc > 1:2097881‑M2/1‑61 (MQ=255) gCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:23024211‑M1/68‑1 (MQ=255) gCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:11896538‑M1/68‑1 (MQ=255) ccACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:26380876‑M1/1‑67 (MQ=255) cACGGCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGCGCAACGGTTTATGGAGAGTGAATCGCACCCGACCCGCGg > 1:3120938‑M1/1‑67 (MQ=255) gcccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcggg > 1:24788415‑M2/1‑56 (MQ=255) ccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC > 1:35863434‑M1/1‑68 (MQ=255) cAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggt < 1:15277101‑M1/68‑5 (MQ=255) gCACCTGTCACTCTTCGCGCCACGGTTTCAGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgc > 1:33379107‑M2/1‑48 (MQ=255) gCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgcagc > 1:25497426/1‑68 (MQ=255) gCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgcagc > 1:3638810/1‑68 (MQ=255) gCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgcagc > 1:37268699/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGCATGAATGGCACCCGACCCCCGCGGGTCtggtgc < 1:8724818‑M1/66‑7 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcg < 1:19654974‑M2/54‑9 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgc < 1:37736474‑M1/66‑7 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgc < 1:33324640‑M1/66‑7 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:25191329/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:4262603/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGCCAGCAc > 1:12960806/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCCACCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgcca > 1:3688560‑M2/1‑46 (MQ=255) ccTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACg > 1:24554628/1‑68 (MQ=255) cTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccat < 1:7441343‑M2/67‑24 (MQ=255) cTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcggggctggtggcatt < 1:7889269‑M2/68‑25 (MQ=255) cacTCTTCGCCCAACGGTTTACCCAGCGTGAATGCCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcac > 1:18085747‑M2/2‑40 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcac > 1:17591424‑M2/1‑40 (MQ=255) aCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcac > 1:37087759‑M1/1‑53 (MQ=255) aCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:13520787/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcac < 1:4883005‑M2/65‑28 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCCCGTTGAgg > 1:10321902/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:8321170/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:36740667/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:6111203/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:28782811/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:18953235/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGc < 1:38173918/68‑1 (MQ=255) tctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcggggctggtggcattcacgctg < 1:29497276‑M2/68‑32 (MQ=255) tctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGATGAGGcc > 1:10067344/1‑68 (MQ=255) tctTCGAACAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactct > 1:32867452‑M1/1‑51 (MQ=255) ctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgc > 1:18392862‑M2/1‑36 (MQ=255) ctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgc < 1:29301334‑M1/68‑19 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCaa > 1:19437489/1‑68 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTTAATGCAGCGTGAAGGGCACCCGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgca < 1:2072754‑M1/68‑20 (MQ=255) aGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTg > 1:14386754/1‑68 (MQ=255) aGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTg > 1:29911642/1‑68 (MQ=255) aaCGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTc > 1:23442859/1‑68 (MQ=255) gTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCa > 1:11520561/1‑68 (MQ=255) tttATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCaa > 1:26285049/1‑68 (MQ=255) ttATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgct < 1:35403236‑M1/67‑32 (MQ=255) aTGCAGAGTGAATGGCACCAgccccgcgcgggtgtggtggcgttccctctgcattaaccgttgctcga < 1:16125706‑M2/68‑49 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaa < 1:19007080‑M2/68‑50 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCtt > 1:5380818/1‑68 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCtt > 1:9060750/1‑68 (MQ=255) tGCAGAGTCAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaa > 1:4128606‑M2/1‑19 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaag > 1:1687237‑M1/1‑32 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:27697086/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:7001337/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTACGGCAATCTta > 1:27823559/1‑68 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaaga > 1:835316‑M2/1‑17 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTtat > 1:23908703/1‑68 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTtat > 1:32976637/1‑68 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTtat > 1:26677236/1‑68 (MQ=255) gagTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTtata > 1:30603958/1‑67 (MQ=255) agTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATaa > 1:16341015/1‑67 (MQ=255) gggaaTGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagtt > 1:5187751‑M2/3‑13 (MQ=255) gTGAATGGCACCCGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagt < 1:38798371‑M1/66‑40 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccaggcactctgcattcaccgttgctcgttgagtt > 1:33726103‑M1/1‑27 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:6843573/1‑68 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:35034128/1‑68 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:6661656/1‑68 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:10755844/1‑68 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:1795110/1‑68 (MQ=255) tGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattaactctgcataaaccgttgctagaagagttacaggt < 1:24636696‑M2/68‑61 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt > 1:3625986‑M1/1‑22 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttaaaggt > 1:4677870‑M1/1‑22 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACg > 1:2053044/1‑68 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACg > 1:18504662/1‑68 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACg > 1:15757896/1‑68 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACg > 1:32320085/1‑68 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACg > 1:1258883/1‑68 (MQ=255) gCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt < 1:37822634‑M2/66‑61 (MQ=255) gCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt < 1:20025457‑M2/66‑61 (MQ=255) gCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt < 1:13233910‑M2/66‑61 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt > 1:11715993‑M1/1‑20 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:38627054/1‑68 (MQ=255) 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aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:3215800/1‑67 (MQ=255) aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:343557/1‑67 (MQ=255) | AGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGACGC > CP009273/3630132‑3630266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |