| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2657620 | 308 (0.650) | 18 (0.050) | 8/94 | NT | 6.0% | intergenic (+16/‑129) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2657626 | 305 (0.770) | intergenic (+22/‑123) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase | |||||
Only 100 of 579 total aligned reads displayed.
AAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTT > CP009273/2657552‑2657686 | aaGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACTAGTTAAGCGACGCTCTGAAGC‑‑TAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:471951/68‑1 (MQ=255) aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA < 1:1775159‑M1/68‑1 (MQ=255) aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA > 1:753262‑M1/1‑68 (MQ=255) aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA > 1:1577481‑M1/1‑68 (MQ=255) aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA > 1:5725779‑M1/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:35469338/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:29275621/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:2840668/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:19737850/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:25423740/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:14114539/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:23168815/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:12658183/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:21293819/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:771003/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:8379447/1‑68 (MQ=255) cttGCTGTCTAATATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGATGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:26166242/64‑1 (MQ=255) cATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:33918291/66‑1 (MQ=255) cATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:9303445/66‑1 (MQ=255) cATGCGGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:32705184/66‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:27813590/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:37351855/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:31322426/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:39137357/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:5918702/68‑1 (MQ=255) gCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtcac < 1:22221273/68‑1 (MQ=255) ggCGAACATGCGTGACTAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtca > 1:25788809‑M2/1‑65 (MQ=255) ggCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtca > 1:3753304‑M2/1‑65 (MQ=255) gAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacc > 1:39018710‑M2/1‑62 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccg < 1:14688428‑M2/67‑8 (MQ=255) cGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGCCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTc > 1:22563026/1‑67 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:38683287‑M2/1‑54 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:13419377‑M2/1‑54 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:9864912/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:16478737/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCt < 1:1121602/68‑1 (MQ=255) aGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCa > 1:18579541/1‑68 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgc < 1:37968300‑M1/68‑30 (MQ=255) tAAGCGACGCGCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgc > 1:21729797‑M2/1‑45 (MQ=255) aaGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgct > 1:10688499‑M2/1‑44 (MQ=255) aaGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgct > 1:11564848‑M2/1‑44 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttc > 1:29141988‑M1/1‑36 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:34808297/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:36685618/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:16983554/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:4850709/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:4447152/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:26959662/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:18730844/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGACGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:34502978/1‑68 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc > 1:15248150/1‑68 (MQ=255) ctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCTCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGaa < 1:31231115/68‑1 (MQ=255) ctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGaa < 1:14376996/68‑1 (MQ=255) ctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGaa < 1:5375454/68‑1 (MQ=255) tGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtc > 1:38357993‑M2/1‑33 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt < 1:26634511/68‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACACACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:700096/1‑68 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgctt > 1:6733799‑M1/1‑24 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgctt > 1:10067844‑M1/1‑24 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgctt > 1:21506675‑M1/1‑24 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgctt > 1:20478894‑M1/1‑24 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:30842685/1‑66 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:24613369/67‑1 (MQ=255) gCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt > 1:17383079/1‑68 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACtt > 1:29798508/1‑67 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:10359100/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTc < 1:18824492/68‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:24870914/67‑1 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtccttaacgcttcagagcgtcgcgtaactcgtc > 1:2768548‑M1/1‑16 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttacctcgtc > 1:6263785‑M1/1‑15 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCTAAATACTTCCTCACt < 1:32275998/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:963906/68‑1 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcac > 1:28873863‑M1/1‑14 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCGTTTCAGGCGCTAATGCGATCTACTTCATGACt > 1:31628975/1‑67 (MQ=255) cTCAGGCGGGTTATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:325006/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:25957057/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:21160844/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:18033438/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:30299261/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:16744431/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCACCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:11917997/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCTCGCGCTATTCCGATATACTTCCTCACTCCt > 1:8073546/1‑68 (MQ=255) ggCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatg > 1:17136866‑M1/1‑9 (MQ=255) ggCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatg > 1:10197331‑M1/1‑9 (MQ=255) ggCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatg > 1:33158585‑M1/1‑9 (MQ=255) gCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgt > 1:8857406‑M1/1‑8 (MQ=255) gCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcat < 1:35159293‑M1/66‑59 (MQ=255) cGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgt > 1:19553569‑M1/1‑7 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCttt < 1:13114118/65‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct > 1:1924496/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct > 1:36356080/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:27266804/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:18206484/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:23712000/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:38106016/67‑1 (MQ=255) tgagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgc > 1:3779769‑M1/1‑3 (MQ=255) tgagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgc > 1:33537066‑M1/1‑3 (MQ=255) gagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgcca > 1:27575518‑M1/1‑2 (MQ=255) gagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgcca > 1:36086997‑M1/1‑2 (MQ=255) gATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttctt > 1:5165521/1‑68 (MQ=255) | AAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTT > CP009273/2657552‑2657686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |