| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2657620 | 308 (0.650) | 18 (0.050) | 8/94 | NT | 6.0% | intergenic (+16/‑129) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2657626 | 305 (0.770) | intergenic (+22/‑123) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase | |||||
Only 100 of 421 total aligned reads displayed.
GCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTCAC > CP009273/2657559‑2657693 | gCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCAGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtcac < 1:5337291/68‑1 (MQ=255) cTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtcac > 1:4589129/1‑67 (MQ=255) ggCGAACATGCGTGACTAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtca > 1:25788809‑M2/1‑65 (MQ=255) cGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcac < 1:4739038‑M2/67‑5 (MQ=255) cGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcac < 1:7652384‑M2/67‑5 (MQ=255) cGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcac < 1:13191014‑M2/67‑5 (MQ=255) gAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcaccc > 1:14615604‑M2/1‑62 (MQ=255) aaCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcaccc < 1:9641716‑M2/67‑7 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgc > 1:21377251‑M2/1‑60 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgc > 1:8857406‑M2/1‑60 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccg > 1:37775467‑M2/1‑60 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccg > 1:32437335‑M2/1‑60 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccg > 1:19553569‑M2/1‑60 (MQ=255) cGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGCCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTc > 1:22563026/1‑67 (MQ=255) cGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGAATCAGGCGGGTGATAACACTCACCCGCCCTc > 1:7913400/1‑67 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCg > 1:17657230/1‑67 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:939524/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:20469620/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:9864912/67‑1 (MQ=255) gAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTc > 1:11508202/1‑68 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGgc < 1:21540259/68‑1 (MQ=255) tAACCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGgc < 1:36553868/68‑1 (MQ=255) aaGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgct > 1:10067844‑M2/1‑44 (MQ=255) aGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGgcgc < 1:17238821/68‑1 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:26349993/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCCCCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:38078969/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt < 1:14226282/66‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt < 1:22304620/66‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:35480378/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:35061388/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:26959662/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:2745157/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:32146909/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:28565987/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:31290529/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:29754990/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:3885369/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:11044048/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:12788303/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:4850709/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:6379262/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:15391943/1‑68 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:8349702/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:12012099/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc > 1:15248150/1‑68 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:2766736/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:33664997/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:17995326/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:4058946/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:25478584/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:36302764/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:24468659/68‑1 (MQ=255) ctGACGCGTTAATGACTCAGGCGGGGGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcggc > 1:2125628‑M2/1‑34 (MQ=255) ctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGaa < 1:30133851/68‑1 (MQ=255) ctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGaa < 1:10240358/68‑1 (MQ=255) ctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGaa < 1:16331508/68‑1 (MQ=255) gACGCGTTAATGACCCCGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgc > 1:16837039‑M2/1‑32 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:29155572/67‑1 (MQ=255) gCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt > 1:36077272/1‑68 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACtt < 1:34707551/67‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:10359100/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:38235223/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:21111148/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTc < 1:18824492/68‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:19801342/67‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:24870914/67‑1 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCCCCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:32903570/1‑66 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:19341832/1‑66 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:35222688/1‑66 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:10875185/1‑66 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCta > 1:27788138/1‑64 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:30855856/1‑65 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:11861517/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:23074461/68‑1 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCGTTTCAGGCGCTAATGCGATCTACTTCATGACt > 1:31628975/1‑67 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:7338835/1‑67 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:22040044/1‑67 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:3741055/1‑67 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:30366809/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:32647527/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:25957057/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:26671371/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:16663291/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:27162632/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCTCGCGCTATTCCGATATACTTCCTCACTCCt > 1:8073546/1‑68 (MQ=255) tCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCt < 1:38463773/68‑1 (MQ=255) cAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCtt > 1:34376223/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCttt < 1:6775680/65‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct > 1:5970014/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct > 1:16993661/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:18206484/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:5773614/67‑1 (MQ=255) gggTGATATCACTCACCCGCACTCGCCTTTCACGCGCTATTCCGAAATACTTACTCACTGGTTAAcgt > 1:18641257/1‑66 (MQ=255) tGATATCAATCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttc < 1:23653058/67‑1 (MQ=255) gATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttct < 1:36987956/67‑1 (MQ=255) tatCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttcttt < 1:2891906/67‑1 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:33245317/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGt < 1:27992281/68‑1 (MQ=255) cactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTc < 1:4951957/68‑1 (MQ=255) actcacCCGCCCGCGCCTTTCGGGCGCTATTCCGAAATACTTCGTCAGTGCTTTACTTTGTTTCGACa > 1:18554079/1‑68 (MQ=255) | GCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTCAC > CP009273/2657559‑2657693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |