| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3202572 | 315 (0.670) | 27 (0.070) | 9/92 | NT | 10.7% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| ? | CP009273 | = 3202615 | 194 (0.500) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Only 100 of 429 total aligned reads displayed.
TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 | gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:33253569/1‑67 (MQ=255) ccAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCAc > 1:12107415/1‑68 (MQ=255) cAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagc < 1:15139500‑M1/67‑4 (MQ=255) cAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCAc < 1:30912644/67‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:1756943/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:2198819/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGGGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:37376504/68‑1 (MQ=255) aCGATTGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:20804181/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:2658309/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:31107686/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:17776719/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:1657325/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:16294210/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:15586377/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:36745120/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:30109501/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:29129056/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:5084162/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:12743322/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:28904233/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:2237703/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:2318756/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:30725466/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:28276224/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt > 1:1967786/1‑68 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:10629537/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:5187117/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:18246450/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:37875675/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:35703081/68‑1 (MQ=255) gatggtgatgggGCCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:15313509/68‑1 (MQ=255) tgatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGtata > 1:18720497/1‑66 (MQ=255) gatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTACGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATAcc > 1:31943811/1‑67 (MQ=255) atggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCt > 1:13331978/1‑67 (MQ=255) gtggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:20949706/1‑66 (MQ=255) gtggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:1703062/1‑66 (MQ=255) gtggCGTTGATAGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:27636554/1‑66 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:21632488/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:29728495/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:25946139/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGGTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:38180607/67‑1 (MQ=255) cGTTGATTGTGGTGTTTTCTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGctct < 1:34219144/67‑1 (MQ=255) gTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCg < 1:10298789/68‑1 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:9925547/68‑1 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:14847841/68‑1 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACATCCGCTCTCGc > 1:2120885/1‑67 (MQ=255) ttGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCAcc < 1:24123513/67‑1 (MQ=255) ttGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCAcc < 1:36075530/67‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:5351660/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:6473628/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:1302587/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:27991557/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:24315584/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:9762432/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:1597025/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:9168946/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:3292265/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:19261191/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga > 1:9478532/1‑68 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga > 1:34799996/1‑68 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTACGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCCCTCTCGCACCgatga > 1:22887152/1‑68 (MQ=255) tgtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggt < 1:38804015‑M1/67‑34 (MQ=255) tgtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatgatg > 1:4188392/1‑68 (MQ=255) ttttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatgatga < 1:29417445/67‑1 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAtt > 1:16705858/1‑65 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct < 1:6676375/68‑1 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct < 1:23521205/68‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:31494074/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:13560227/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:1390273/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:7964354/1‑66 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcagtcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtg > 1:3753019‑M1/1‑24 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtg > 1:27321124‑M1/1‑24 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:32627633/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:6946959/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:24024251/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:35567352/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:8301106/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:19503796/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACATCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:25380144/1‑67 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:17307984‑M2/1‑66 (MQ=255) tGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc < 1:20022018‑M2/67‑3 (MQ=255) gcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctg < 1:1437333‑M2/68‑7 (MQ=255) tACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggc > 1:24482354‑M2/1‑60 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:26773631‑M2/1‑59 (MQ=255) ttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATg < 1:4664819/68‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaa > 1:33499659‑M1/1‑11 (MQ=255) tCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGGTGCTGCGCTGCCGATGCCg < 1:7336100/68‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCg < 1:2860942/68‑1 (MQ=255) gCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctgcgaaaaagta > 1:842486‑M1/1‑8 (MQ=255) gCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGa > 1:37158466/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagta > 1:624996‑M1/1‑7 (MQ=255) ccAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGaa > 1:34954574/1‑68 (MQ=255) cAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagc < 1:1088126‑M1/68‑63 (MQ=255) cAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagc > 1:3860822‑M2/1‑49 (MQ=255) cAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGaa < 1:7453651/67‑1 (MQ=255) cgcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgca > 1:601940‑M1/1‑3 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgcag > 1:33898699‑M1/1‑2 (MQ=255) gcCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgc > 1:7576797‑M2/1‑45 (MQ=255) gcCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATccc > 1:11421510/1‑68 (MQ=255) | TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |