| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4034176 | NA (NA) | 29 (0.070) | 6/92 | NT | 9.0% | intergenic (+180/+90) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B |
| ? | CP009273 | = 4034200 | 359 (0.760) | intergenic (+204/+66) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B | |||||
Only 100 of 976 total aligned reads displayed.
ACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGC > CP009273/4034140‑4034265 | aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTcttg > 1:8061838‑M2/1‑61 (MQ=255)aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgc > 1:34553903‑M2/1‑61 (MQ=255)aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCAt > 1:22075870/1‑68 (MQ=33) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCAtt > 1:27984573/1‑68 (MQ=35) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCAtt > 1:4508552/1‑68 (MQ=35) ccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGgc < 1:26254126/68‑1 (MQ=40) aTAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGa < 1:17635853/68‑1 (MQ=255) cTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGaaaaaa > 1:1674958/1‑68 (MQ=255) cTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGAAGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGaaaaaa > 1:38062109/1‑68 (MQ=255) cAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATg > 1:14504787/1‑67 (MQ=255) cATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCgg < 1:33343894/67‑1 (MQ=255) tCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATg < 1:9344684/68‑1 (MQ=255) aGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:18962741/1‑68 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:35173207/1‑67 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:29469444/1‑67 (MQ=255) cAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTATTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTgg > 1:8475245/1‑67 (MQ=255) aGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTgg < 1:14011089/66‑1 (MQ=40) aGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTgg < 1:12585579/66‑1 (MQ=40) aGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTgg < 1:31690471/66‑1 (MQ=40) aGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTgg < 1:25042807/66‑1 (MQ=40) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:10030797/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:32502635/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:36225845/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:11918780/68‑1 (MQ=255) gCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCt > 1:32807452/1‑68 (MQ=255) ccATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCtt > 1:21214774/1‑68 (MQ=255) cATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTa < 1:7702051/68‑1 (MQ=255) aTCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAACTGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 1:12220521/68‑1 (MQ=255) ccTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATcc > 1:18480227/1‑68 (MQ=255) ccTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATcc > 1:20879315/1‑68 (MQ=255) tGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAg < 1:4068437/68‑1 (MQ=255) tGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAg < 1:32221932/68‑1 (MQ=255) tGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAg < 1:5306040/68‑1 (MQ=255) tGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAg < 1:35517087/68‑1 (MQ=255) tGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAg < 1:17345163/68‑1 (MQ=255) gACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGc < 1:36456888/68‑1 (MQ=255) gACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGc < 1:26824617/68‑1 (MQ=255) gACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGc < 1:17968605/68‑1 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:20098893/1‑68 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:23360103/1‑68 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:626820/1‑68 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgcccccctccggg < 1:38292850‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:30064379‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:6958781‑M2/67‑58 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:38734689‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:25562162‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:37711452‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:19716379‑M2/68‑60 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:37379075‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:31442988‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:28986366‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:36828379‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:11537520‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:25368990‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:15278715‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc > 1:15513040‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:8843057‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:16336218‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:7297983‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:2046994‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTTTTGCATTGGCGCAAAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGACTAc > 1:5868872/1‑67 (MQ=255) tGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg > 1:27098034‑M2/1‑7 (MQ=255) tGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAct < 1:10928286/67‑1 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:27349320‑M2/68‑63 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:13022139‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:15718894‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcgaaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtactgccggccaccctccgggccgtt > 1:24213877‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTActct > 1:11167908/1‑68 (MQ=255) gCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:23904081‑M2/67‑63 (MQ=255) gCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:24587746‑M2/67‑63 (MQ=255) gCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:5601916‑M2/67‑63 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:22630218‑M2/66‑63 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:26378913‑M2/66‑63 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:4964261‑M2/66‑63 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:6683075‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:36984239‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct > 1:10530355‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:34182570‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:32951582‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:30755681‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:22390080‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:23262059‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:9850671‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:35898000‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:13380651‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:1489609‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:15979149‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:19370084‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:21598375‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:23742593‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:2577863‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:28801515‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:29718239‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:3037701‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:31034091‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:3360211‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:28598968/67‑1 (MQ=255) cTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:13747944/67‑1 (MQ=255) cTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGc < 1:33912530/68‑1 (MQ=255) ttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:39090426‑M2/67‑66 (MQ=255) | ACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGC > CP009273/4034140‑4034265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |