| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 830751 = | 513 (1.090) | 26 (0.060) | 10/98 | NT | 6.5% | coding (48/963 nt) | ybiB | putative family 3 glycosyltransferase |
| ? | CP009273 | 830783 = | 296 (0.720) | coding (80/963 nt) | ybiB | putative family 3 glycosyltransferase | |||||
Only 100 of 594 total aligned reads displayed.
AAAATCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAGTCCCTGACCTTGAGTTGGGCGGCGTATTGATTGCGCT > CP009273/830716‑830849 | aaaTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAACCCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGt < 1:6336778/68‑1 (MQ=255) aaaTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGt < 1:16806711/68‑1 (MQ=255) aaaTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGt < 1:10898432/68‑1 (MQ=255) aaaTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGt < 1:35534871/68‑1 (MQ=255) aaaTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGt < 1:4372833/68‑1 (MQ=255) aaTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACTAGCGCGATTTAGCCCGGGATACTGCGCGCGGTc < 1:8724032/68‑1 (MQ=255) aaTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCgg > 1:5981747/1‑66 (MQ=255) aaTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTc < 1:35835877/68‑1 (MQ=255) aaTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTc < 1:4125212/68‑1 (MQ=255) gacttcaccattgagcatatgagcatacagaccgcgcgcagtatcccggtctaaatcgcgcgcgGt < 1:26856185‑M2/2‑1 (MQ=255) gacttcaccattgagcatatgagcatacagaccgcgcgcagtatcccggtctaaatcgcgcgcgGt < 1:27967953‑M2/2‑1 (MQ=255) gacttcaccattgagcatatgagcatacagaccgcgcgcagtatcccggtctaaatcgcgcgcgGTc < 1:19048079‑M2/3‑1 (MQ=255) aTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCgg > 1:24796553/1‑65 (MQ=255) aTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCt < 1:18843974/68‑1 (MQ=255) aTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCt < 1:27375510/68‑1 (MQ=255) aTCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCt < 1:33904163/68‑1 (MQ=255) tCATTACAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTg < 1:32929626/68‑1 (MQ=255) cttcaccattgagcatatgagcatacagcccgcgcgcagtatcccggtctaaatcgcgcgcgGTCTGt < 1:4953224‑M2/6‑1 (MQ=255) cttcaccattgagcatatgagcatacagaccgcgcgcagtatcccggtctaaatcgcgcgcgGTCTGt < 1:31385977‑M2/6‑1 (MQ=255) cttcaccattgagcatatgagcatacagaccgcgcgcagtatcccggtctaaatcgcgcgcgGTCTGt < 1:9715276‑M2/6‑1 (MQ=255) cATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGt < 1:36919221/68‑1 (MQ=255) cATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGt < 1:10448618/68‑1 (MQ=255) cATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGt < 1:20393352/68‑1 (MQ=255) aTTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGta < 1:24675459/68‑1 (MQ=255) tcaccattgagcatatgagcatacagaccgcgcgcagtatcccggtctaaatcgcgcgcgGTCTGtat < 1:32113997‑M2/8‑1 (MQ=255) tcaccattgagcatatgagcatacagaccgcgcgcagtatcccggtctaaatcgcgcgcgGTCTGtat < 1:22714989‑M2/8‑1 (MQ=255) aaGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCTCGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGtatgct < 1:19421031/68‑1 (MQ=255) aaGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGtatgct < 1:13105053/68‑1 (MQ=255) aaGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGtatgct < 1:19662522/68‑1 (MQ=255) 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agcatacagacCGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATgg < 1:37660771‑M1/57‑1 (MQ=255) gAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGt < 1:30370207/67‑1 (MQ=255) atacagacCGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGa < 1:12533739‑M1/60‑1 (MQ=255) atccACGCGCGCGATTTAGACCGGTATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAGt < 1:31929351/66‑1 (MQ=255) aaCCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAg > 1:27074194/1‑67 (MQ=255) aaCCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAGt < 1:14619986/68‑1 (MQ=255) aaCCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAGt < 1:10187315/68‑1 (MQ=255) aaCCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAGt < 1:21619618/68‑1 (MQ=255) acCGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAGTc < 1:32680732‑M1/64‑1 (MQ=255) GCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAGTCCCTGa > 1:29098067‑M1/1‑68 (MQ=255) 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gcgGGCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAGTCCCTGACCTTGAGTTGGGCGGCGTATTGATTgc > 1:9236707‑M2/4‑67 (MQ=255) | AAAATCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGAAAAACCACGCGCGCGATTTAGACCGGGATACTGCGCGCGGTCTGTATGCTCATATGCTCAATGGTGAAGTCCCTGACCTTGAGTTGGGCGGCGTATTGATTGCGCT > CP009273/830716‑830849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |