| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3615265 | NA (NA) | 6 (0.010) | 4/100 | NT | 100% | coding (2714/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3615283 | 0 (0.000) | coding (2732/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCG > CP009273/3615218‑3615350 | caccacCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCCCAGACCCGGCTCGTAACATCCTGCCg < 1:38287196‑M2/67‑2 (MQ=255) cGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgt > 1:36157942‑M2/1‑60 (MQ=255) cGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATCCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgt > 1:24253971‑M2/1‑60 (MQ=255) aGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcattcgggatgcggatatccagattcgctgcggt < 1:8988383‑M2/68‑45 (MQ=255) aGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggt < 1:29698340‑M2/68‑45 (MQ=255) cccGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggt < 1:11223957‑M2/68‑48 (MQ=255) gCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtga < 1:32795625‑M2/68‑52 (MQ=255) aCCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccgg < 1:29982084‑M2/68‑59 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcg < 1:22276267‑M2/67‑62 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:10140149‑M2/67‑62 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:21016276‑M2/67‑62 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:17655911‑M2/67‑62 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:36287118‑M2/67‑62 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:37915051‑M2/67‑62 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:6899035‑M2/67‑62 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:6411729‑M2/67‑62 (MQ=255) cTGCGgggtctgtggcatacgggttgcggatatccagaatggctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:2384397‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:20370276‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:2092750‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:10201081‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:21648412‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:2189607‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:8700324‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:2384377‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:24832353‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:25811323‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:37933508‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:30701897‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:37738289‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:34831419‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:35164150‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:19962086‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:19937630‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:19530624‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:1196864‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:13044823‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:13304058‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:13510963‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:17879719‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:1150483‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:17209999‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:17039879‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:11425476‑M2/67‑63 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:1467919‑M2/67‑63 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggccagc > 1:8488955‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcacacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:7572093‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctggggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:43423‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctggggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:28730669‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgcggcatacgcgatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:2587682‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtcgggggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:28844466‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCggggctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:37979994‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCggggctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:37514812‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCggggctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:4183163‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:11063988‑M2/1‑4 (MQ=255) tGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:549882‑M2/1‑4 (MQ=255) tGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:65301‑M2/1‑4 (MQ=255) tGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccacattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:21822767‑M2/1‑4 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:36037651‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:16896589‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:20034870‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:12216146‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:37820968‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:19011793‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:11907262‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:26555404‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:37209882‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:37014313‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:28467183‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:360252‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:29143103‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:8883933‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:14528475‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:30250629‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:17602743‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:24533092‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctctggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggaggtgtgaacgccggtcag < 1:30712031‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCggctctgtggcaaacgggatgcggataaccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcgt < 1:617744‑M2/68‑66 (MQ=255) ccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcct < 1:26638215‑M2/67‑66 (MQ=255) cgtgtcggcggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:33718302‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:10881396‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:8801358‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:8409286‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:21100176‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:18007065‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:31432372‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:22434225‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:24730707‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:16694327‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg < 1:2940339‑M2/67‑67 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:15583694‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:30014575‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:38125197‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:14319531‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg < 1:35408442‑M2/67‑67 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg < 1:13157108‑M2/67‑67 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:36915318‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:37644933‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggaggtgtgaacgccggtcagcctg < 1:6341268‑M2/67‑67 (MQ=255) cggggctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:14338901‑M2/1‑1 (MQ=255) | CACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCG > CP009273/3615218‑3615350 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |