New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 248326 = | 158 (0.450) | 8 (0.030) | 5/96 | NT | 5.4% | coding (942/1056 nt) | dinB | DNA polymerase IV |
? | CP009273 | 248370 = | 143 (0.470) | coding (986/1056 nt) | dinB | DNA polymerase IV |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GCAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/248399‑248326 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgcggtgTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATT > CP009273/248370‑248436 GCAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:21436828/1‑68 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:2831832/1‑67 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:28796231/1‑67 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:9457838/1‑67 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:18887207/1‑67 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:6020492/1‑67 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:20387742/1‑67 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:11379442/1‑67 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:4013647/1‑67 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:4188968/1‑67 CAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC > 1:5275063/1‑67 AACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGC > 1:17945413/1‑68 AACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGC < 1:25986121/66‑1 ACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCG < 1:13203648/68‑1 ACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCG < 1:13084505/68‑1 ACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCG < 1:21029762/68‑1 ACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCG < 1:7505058/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:23494351/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:5897298/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:397520/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:19756802/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:25139346/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:6731452/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:26758207/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:7876153/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:8190158/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:8497234/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:791473/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:9034241/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:782133/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:11163760/68‑1 GTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGT < 1:11120521/68‑1 TCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGTG > 1:17355322/1‑68 GCAGCCCCCCCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGTGTGCGTC < 1:8348289/68‑1 CACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGG < 1:14256417/68‑1 CACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGG < 1:28646609/68‑1 ACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCCGGTTTTACGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGG < 1:459168/68‑1 ACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGG < 1:9163683/68‑1 ACGCACACCGCGCCCGCCCCGGCGATCAACCCAGGTTTTCCGCGCGGGGTGCGTCTGGTGGGGCTGCA < 1:1455564/68‑1 CGCACCCCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCCGGTTTTACGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCA < 1:25336905/67‑1 GCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTG < 1:19761383/67‑1 CGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGT > 1:7645063/1‑65 GGTGTGCGTGTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:18319946/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTTGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:16274753/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCCTGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:5065109/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACATCTGGTGCTGGG < 1:4105644/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTTGG < 1:29231136/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:8180420/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:5450296/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:557811/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:7822970/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:3699396/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:5962574/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:3088358/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:6529174/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:9706785/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:2756364/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:25766558/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:16186200/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:22151394/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:21731403/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:20908964/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:27249540/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:19152183/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:1722686/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:17064528/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:16266438/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:20432334/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:13702988/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:1319155/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:1207409/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:11375139/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:11303464/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:11144380/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:11046989/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:23761042/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:26722946/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:26553995/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:26083681/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:25299608/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:25041538/68‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGG < 1:9454960/67‑1 GGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGG < 1:26597038/67‑1 GGTGGGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:25920815/68‑1 GTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGG < 1:12784299/67‑1 TGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGA < 1:18452179/67‑1 TGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGA < 1:728753/67‑1 TGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGA < 1:19688447/67‑1 TGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGA < 1:28113658/67‑1 TGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGA < 1:333284/67‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATT < 1:554407/68‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGAT < 1:23493985/67‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGAT < 1:24754996/67‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGAT < 1:23884762/67‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGAT < 1:3057094/67‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGAT < 1:14005469/67‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGAT < 1:15891957/67‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGAT < 1:10940845/67‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGAT < 1:23973089/67‑1 GTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGAT < 1:18196874/67‑1 GCAACGTCACATGCAGCCCCACCAGACGCACACCGCGCCCGCCGCGGCGTTCATCCCAGGTTTTACGCGCGGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/248399‑248326 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgcggtgTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATT > CP009273/248370‑248436 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |