| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 725679 | NA (NA) | 9 (0.030) | 8/100 | NT | NA | coding (641/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | = 725702 | NA (NA) | coding (664/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725608‑725679‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtggaACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < CP009273/725702‑725637 GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACTGGGTACTGA‑CCGGGCTGG > 1:4555009/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG > 1:10081078/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG > 1:27361944/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG > 1:27811395/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG > 1:8455446/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG > 1:17924482/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG > 1:20125288/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGC‑CCGGGCTGGT > 1:7155802/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:16528835/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:24461021/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:17041448/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:4595830/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:18605685/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:19889498/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:20062728/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:28415073/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:23321695/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:24658745/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:5966665/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:9360201/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:11631913/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:12832996/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:8217015/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:13666794/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:7399150/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:1451938/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:6626856/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT > 1:5042273/1‑68 tGGTGCCGGAAGCGGTTGTGGTGCTGCCTGCGCCTCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG < 1:26775112/65‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:15239285/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:14323472/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:6227532/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:17336981/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:16313723/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:26830765/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:9186020/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG < 1:3812201/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG < 1:4835241/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG < 1:28081492/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG < 1:25846507/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG < 1:98426/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGG < 1:23403241/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGGGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:9772459/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGGGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:23904850/67‑1 GGGGGCCGGAAGCGGATGAGGGGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGT < 1:2254660/67‑1 GGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGG > 1:13774600/1‑68 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGG < 1:328031/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGG < 1:22072266/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGG < 1:13839627/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGG < 1:6998196/67‑1 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGA > 1:15863708/1‑67 TGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCG < 1:20841973/67‑1 TGAGGTGCGGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGC < 1:24525891/68‑1 GAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCC < 1:1306796/68‑1 TGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:28346265/68‑1 TGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:17606360/68‑1 GCGCCGCTGACGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:21151925/68‑1 CGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAG < 1:10363432/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCCGGGCTGGGGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:28173206/68‑1 GTACCGGGGACTGA‑CCGGGCGGGTGGAACGGCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:5066421/68‑1 GGTTGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGG < 1:21542436/67‑1 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAGGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:5115520/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:15376524/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC < 1:6109664/68‑1 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:4334847/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:26427343/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:28256825/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:22814057/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:29246602/47‑1 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:9821414/47‑1 GGTGGAACGTCTCTGGGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC < 1:6367121/68‑1 GGTGGAACGGCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGG < 1:8685405/67‑1 GGTGGAACGGCTGTGGGCGCCCGAAGCGGGCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGG < 1:3291361/67‑1 GTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:16399353/1‑67 gGGAACGGCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCG < 1:11437168/66‑1 TGGAACGTCTGTGTTCGCGCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTGAGTACCCGGTACGGAGGCAGCTGCG < 1:28920539/67‑1 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:26945457/1‑68 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:21202214/1‑68 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:8664952/1‑68 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:16450290/1‑68 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:10096146/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:24247454/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:12909929/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:4983048/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:18236299/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < 1:18520913/67‑1 GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGA‑CCGGGCTGGTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725608‑725679‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtggaACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < CP009273/725702‑725637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |