New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3614222 | NA (NA) | 4 (0.010) | 3/102 | NT | 100% | coding (1671/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
? | CP009273 | = 3614373 | 0 (0.000) | coding (1822/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCgggca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3614157‑3614222 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTC < CP009273/3614373‑3614303 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG < 1:26988610/68‑1 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:15374218/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:16960140/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG < 1:16989682/68‑1 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG < 1:19524538/68‑1 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:20860070/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:21510238/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG < 1:22635008/68‑1 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:25054481/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG < 1:10721296/68‑1 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:28970295/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:4284315/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:4416416/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:5669480/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:6133638/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG < 1:7168776/68‑1 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:8521412/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:9823883/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:10106745/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG < 1:13782093/68‑1 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:15327935/1‑68 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG < 1:14066780/68‑1 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGATATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGG > 1:19901879/1‑68 ACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGGG < 1:4461756/68‑1 ACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGGG < 1:14280120/68‑1 CGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGGGC < 1:1540376/68‑1 CGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGGGC > 1:11475557/1‑68 CGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGGGC > 1:22990433/1‑68 CGGCCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGCCCATGACCGCTTCGGGC > 1:8910795/1‑68 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TCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGAT < 1:29189037/67‑1 CCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGT < 1:9183280/68‑1 CCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGT < 1:14538783/68‑1 GGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCT < 1:7867104/67‑1 GCAATGACGGCGGTGAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:5286228/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATCCCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:23710229/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:12733866/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT < 1:4391013/67‑1 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:12560215/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:781443/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT < 1:12107999/67‑1 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GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT < 1:20164357/67‑1 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:20174469/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:21034076/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:21101943/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT < 1:21102792/67‑1 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:21489236/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:18717280/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT < 1:21895194/67‑1 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:2258488/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:17600159/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:23269899/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:23518115/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT < 1:24276457/67‑1 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT < 1:14053365/67‑1 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:26889505/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:18918516/1‑67 GCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTT > 1:15991874/1‑67 AATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTC < 1:7416293/67‑1 TACGGTCAGTTGCTGAGCTTCACCGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGTTATGACCATGACCGCTTCgggca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3614157‑3614222 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTC < CP009273/3614373‑3614303 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |