| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3614222 | NA (NA) | 4 (0.010) | 3/102 | NT | 100% | coding (1671/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3614373 | 0 (0.000) | coding (1822/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
ACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAGGGCG > CP009273/3614341‑3614439 | acaTCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccgg < 1:14538783‑M2/68‑36 (MQ=255)acaTCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccgg < 1:9183280‑M2/68‑36 (MQ=255) aTCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccgga < 1:29189037‑M2/67‑37 (MQ=255) tgacctgaccGCCGTCATTGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggt < 1:3548145‑M2/68‑46 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcattgtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:15082544‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:15960331‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:22906779‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:2122158‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:27004896‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:19508110‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:8701113‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:9308861‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:974658‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgacc > 1:12297607‑M2/1‑5 (MQ=255) gCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccg < 1:1540376‑M2/68‑65 (MQ=255) gCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccg > 1:11475557‑M2/1‑4 (MQ=255) gCCCgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccg > 1:22990433‑M2/1‑4 (MQ=255) gCCCgaagcggtcatgggcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactggccg > 1:8910795‑M2/1‑4 (MQ=255) cccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgt < 1:14280120‑M2/68‑66 (MQ=255) cccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgt < 1:4461756‑M2/68‑66 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacatatccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:19901879‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:8521412‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:4284315‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:4416416‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:5669480‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:6133638‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta < 1:7168776‑M2/68‑67 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta < 1:22635008‑M2/68‑67 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:9823883‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:28970295‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta < 1:26988610‑M2/68‑67 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:25054481‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:10106745‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:21510238‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:20860070‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta < 1:19524538‑M2/68‑67 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta < 1:16989682‑M2/68‑67 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:16960140‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:15374218‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta > 1:15327935‑M2/1‑2 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta < 1:14066780‑M2/68‑67 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta < 1:13782093‑M2/68‑67 (MQ=255) ccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactgaccgta < 1:10721296‑M2/68‑67 (MQ=255) | ACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAGGGCG > CP009273/3614341‑3614439 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |