| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2068566 | 254 (0.720) | 13 (0.040) | 6/96 | NT | 5.0% | coding (307/1533 nt) | yeeR | CP4‑44 prophage; putative membrane protein |
| ? | CP009273 | = 2068573 | 276 (0.910) | coding (314/1533 nt) | yeeR | CP4‑44 prophage; putative membrane protein | |||||
Only 100 of 495 total aligned reads displayed.
CTTGATGGTAAACATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACC > CP009273/2068500‑2068633 | cTTGATGGTAAACATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGc < 1:4076727/68‑1 (MQ=255) tGATGGTAAACATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGctc < 1:7160645/68‑1 (MQ=255) tGGTAAACATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCg < 1:18965964/68‑1 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:19062662‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:16500015‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:17449071‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:18757371‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:12510900‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTAACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACAACCGCTCTCGCcggtg < 1:28950110‑M2/68‑6 (MQ=255) cATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtgg > 1:6054970‑M2/1‑62 (MQ=255) atatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGAATCAGTGAAATATATTCTTACAACCGCACTCGCcggtcg < 1:21301215‑M2/67‑7 (MQ=255) tatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtggtc > 1:27236617‑M2/1‑60 (MQ=255) tatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtgg < 1:21097977‑M2/66‑7 (MQ=255) atCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtgg < 1:1376704‑M2/65‑7 (MQ=255) tCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTctg < 1:8668814/68‑1 (MQ=255) cgcgCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTctgc < 1:20627817/68‑1 (MQ=255) gcgcTGGAGGCTCACACCTTTGACTCGGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTct > 1:27915345/1‑65 (MQ=255) gcTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTctgctg > 1:9354565/1‑67 (MQ=255) gcTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTgctgg < 1:18588209/68‑1 (MQ=255) tGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTgctggc < 1:22035260/67‑1 (MQ=255) aGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGt < 1:27505830/67‑1 (MQ=255) ggCTCCCACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGtt < 1:10719400/67‑1 (MQ=255) ggCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGtt < 1:16482985/67‑1 (MQ=255) ggCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGtt < 1:29108856/67‑1 (MQ=255) gCTCACACCTTTGACTCCGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTc > 1:10457663/1‑67 (MQ=255) cTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTcc < 1:20417444/67‑1 (MQ=255) cTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTcc < 1:4835288/67‑1 (MQ=255) tCACACC‑TTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTcccc < 1:24434104/67‑1 (MQ=255) cacCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagag > 1:8067484‑M1/1‑35 (MQ=255) acCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCa > 1:6719152/1‑68 (MQ=255) acCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCa > 1:24775093/1‑68 (MQ=255) acCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCa > 1:3941748/1‑68 (MQ=255) ccTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtggtcagaataaatttcacagagtc > 1:11017078‑M2/1‑40 (MQ=255) ccTTAGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCGCGCcggtgctcagaataaattgcacagagtc > 1:25170515‑M2/1‑40 (MQ=255) cTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGa > 1:20695258/1‑68 (MQ=255) cTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGa < 1:17952502/68‑1 (MQ=255) cTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGa < 1:12937210/68‑1 (MQ=255) cTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGa < 1:25647845/68‑1 (MQ=255) tttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGa > 1:13309783/1‑67 (MQ=255) tttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGAt < 1:12663755/68‑1 (MQ=255) gACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaa > 1:829343/1‑68 (MQ=255) gACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaa > 1:25522419/1‑68 (MQ=255) gACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaa > 1:26140971/1‑68 (MQ=255) aCTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggt > 1:17825056‑M1/1‑27 (MQ=255) aCTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggt > 1:19846439‑M1/1‑27 (MQ=255) ctctGTGAAATTTCTTCTGACCACCGCTCTCGCcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggt > 1:29219479‑M2/1‑33 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACGACCGgcgagagcgggggtcagaattaatttcacagagagaatggtg > 1:28111170‑M1/1‑26 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:139677/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:23618838/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:25294941/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:25913584/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:922244/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:6484151/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:3748485/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:13621138/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:11392055/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaa < 1:2008245/67‑1 (MQ=255) tctGTGAAATTTATTCTGACCACCGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgt > 1:15046041‑M1/1‑25 (MQ=255) tctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:23986265/1‑67 (MQ=255) tctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:16874052/1‑67 (MQ=255) ctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAAc < 1:21615457/68‑1 (MQ=255) aaTTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTca < 1:26366635/67‑1 (MQ=255) aTTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTcagc > 1:10057704/1‑68 (MQ=255) aTTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTcagc > 1:11682039/1‑68 (MQ=255) ttATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTcagcag > 1:17184748/1‑68 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:16338409/68‑1 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:19687472/68‑1 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:15343873/68‑1 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:2683212/68‑1 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:22464865/68‑1 (MQ=255) aTTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGaa < 1:28283012/68‑1 (MQ=255) ttCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAAc > 1:13430188/1‑68 (MQ=255) tCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACg < 1:20850884/68‑1 (MQ=255) tCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACg > 1:7572228/1‑68 (MQ=255) tGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACggg < 1:22971747/68‑1 (MQ=255) tGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACggg < 1:12301745/68‑1 (MQ=255) gACCACCGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgata > 1:5886145‑M1/1‑8 (MQ=255) gACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGa < 1:8889576/68‑1 (MQ=255) gACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGa < 1:19453979/68‑1 (MQ=255) ccaccGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgatatg > 1:11466378‑M1/1‑6 (MQ=255) ccaccGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgatat < 1:22629657‑M1/67‑62 (MQ=255) ccaccGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgatat < 1:21798519‑M1/67‑62 (MQ=255) ccaccGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgatat < 1:18393326‑M1/67‑62 (MQ=255) ccaccGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgata < 1:11209383‑M1/66‑61 (MQ=255) ccaccGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgat < 1:16803167‑M1/65‑60 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATc < 1:14396528/68‑1 (MQ=255) caccGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgatatgt < 1:18735795‑M1/68‑64 (MQ=255) caccGgcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgatatgt < 1:14305276‑M1/68‑64 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:10275619/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:1282501/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:16008851/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:5488391/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:19260611/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:28656825/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:28415726/68‑1 (MQ=255) ggcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgatatgttta > 1:15831333‑M1/1‑1 (MQ=255) ggcgagagcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggtgtgagcctccagcgcgatatgttta > 1:17033938‑M1/1‑1 (MQ=255) gCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACAcc > 1:16410683/1‑68 (MQ=255) gCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACAcc > 1:3139473/1‑68 (MQ=255) gCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACAcc < 1:23048214/68‑1 (MQ=255) | CTTGATGGTAAACATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACC > CP009273/2068500‑2068633 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |