| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2068566 | 254 (0.720) | 13 (0.040) | 6/96 | NT | 5.0% | coding (307/1533 nt) | yeeR | CP4‑44 prophage; putative membrane protein |
| ? | CP009273 | = 2068573 | 276 (0.910) | coding (314/1533 nt) | yeeR | CP4‑44 prophage; putative membrane protein | |||||
Only 100 of 424 total aligned reads displayed.
GTAAACATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCAGAAGAT > CP009273/2068507‑2068640 | aaCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggt < 1:6544247‑M2/68‑5 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:14305276‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:16429218‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:12510900‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:17187611‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:11696703‑M2/68‑6 (MQ=255) aCATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtg < 1:18757371‑M2/68‑6 (MQ=255) cATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtgg > 1:11466378‑M2/1‑62 (MQ=255) atatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtgg < 1:12829461‑M2/67‑7 (MQ=255) atatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtgg < 1:16494437‑M2/67‑7 (MQ=255) tatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtggtc > 1:5886145‑M2/1‑60 (MQ=255) tatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtggtc > 1:19127924‑M2/1‑60 (MQ=255) tatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtggtc > 1:27236617‑M2/1‑60 (MQ=255) tatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtgg < 1:11209383‑M2/66‑7 (MQ=255) tatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtgg < 1:17885387‑M2/66‑7 (MQ=255) tatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCcggtgg < 1:29068455‑M2/66‑7 (MQ=255) tatCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCCCTCACCCcggtgg < 1:9119808‑M2/66‑7 (MQ=255) atCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTct < 1:20418760/68‑1 (MQ=255) tCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTctg < 1:8668814/68‑1 (MQ=255) cgcgCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTctgc < 1:20627817/68‑1 (MQ=255) cgcgCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTctgc < 1:2927184/68‑1 (MQ=255) gcgcTGGAGGCTCACACCTTTGACTCGGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTct > 1:27915345/1‑65 (MQ=255) cgcTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTctgctg > 1:4012228/1‑68 (MQ=255) cgcTGGAGGCTCACACATTTGACTCTGTGAAATATATTCTGACCACCGCTCTCGCCGTTGGTctgctg > 1:1083739/1‑68 (MQ=255) gcTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTctgctg > 1:19904011/1‑67 (MQ=255) tGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTgctggc < 1:22035260/67‑1 (MQ=255) aGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGt < 1:18686246/67‑1 (MQ=255) aGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGt > 1:8861490/1‑67 (MQ=255) ggCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGtt < 1:24716187/67‑1 (MQ=255) ggCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGtt < 1:18436909/67‑1 (MQ=255) ggCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGtt > 1:22994853/1‑67 (MQ=255) gCTCACACCTTTGACTCCGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTc > 1:10457663/1‑67 (MQ=255) cTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTcc > 1:16367897/1‑67 (MQ=255) cTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTcc < 1:11399533/67‑1 (MQ=255) tCACACC‑TTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTcccc < 1:24434104/67‑1 (MQ=255) cacaCCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCt < 1:20718376/68‑1 (MQ=255) acCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCa > 1:13070518/1‑68 (MQ=255) cTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGa < 1:21285119/68‑1 (MQ=255) tttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGa > 1:13309783/1‑67 (MQ=255) tttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGAt < 1:12663755/68‑1 (MQ=255) tttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGAt < 1:1782320/68‑1 (MQ=255) ttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATc > 1:29118328/1‑68 (MQ=255) gACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaa > 1:7787982/1‑68 (MQ=255) gACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaa > 1:26140971/1‑68 (MQ=255) gACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaa > 1:1687215/1‑68 (MQ=255) gACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaa > 1:20123245/1‑68 (MQ=255) aCTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaa > 1:5537699/1‑68 (MQ=255) aCTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaa > 1:934874/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGTAATCATGCATGTTCCCCTGCATATAaaaa > 1:21764807/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:21047104/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:151311/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:27493846/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:25913584/1‑68 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCaaaa > 1:18315169/1‑68 (MQ=255) cgctgtGAAATTTATTCTGACCACCCCGCGCGCcggtggtcagaataaatttcacagagtcaaaggt > 1:8115523‑M2/3‑33 (MQ=255) gtgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACAt < 1:19833238/68‑1 (MQ=255) gtgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACAt < 1:1587003/68‑1 (MQ=255) gtgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACAt < 1:25587583/68‑1 (MQ=255) tttATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTcagca > 1:13827436/1‑68 (MQ=255) ttATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTccgcag > 1:22547465/1‑68 (MQ=255) ttATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTcagcag > 1:28105576/1‑68 (MQ=255) ttATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTcagcag > 1:7471149/1‑68 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:15371928/68‑1 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:23338130/68‑1 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:24001360/68‑1 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:19658348/68‑1 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGa < 1:2683212/68‑1 (MQ=255) aTTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGaa < 1:17064466/68‑1 (MQ=255) ttCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAAc > 1:13430188/1‑68 (MQ=255) tCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACg > 1:16682094/1‑68 (MQ=255) tCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACg < 1:3523127/68‑1 (MQ=255) tCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACg > 1:21347793/1‑68 (MQ=255) tCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACg > 1:2519926/1‑68 (MQ=255) tCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACg > 1:18990239/1‑68 (MQ=255) tGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACggg < 1:25728509/68‑1 (MQ=255) tGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACggg < 1:12301745/68‑1 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATc < 1:14396528/68‑1 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATc < 1:2371264/68‑1 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATc > 1:10580407/1‑68 (MQ=255) accGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcac > 1:6094781/1‑68 (MQ=255) accGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcac > 1:19315111/1‑68 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:22396888/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:5366554/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:10275619/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:3887025/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:28656825/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:28415726/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:28229296/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:16008851/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:26475077/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:24959406/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATcaca < 1:1941999/68‑1 (MQ=255) tctcGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCa < 1:21802553/67‑1 (MQ=255) ctcGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCaga < 1:22820568/68‑1 (MQ=255) ctcGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCaga < 1:1004022/68‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCagaag < 1:13713402/68‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCagaag > 1:25337294/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCagaaga < 1:4142169/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCagaaga < 1:6766107/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCagaaga < 1:11108782/68‑1 (MQ=255) | GTAAACATATCGCGCTGGAGGCTCACACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCAGATCAAAAACATTCAGCAGAACGGGATCACACCAGAAGAT > CP009273/2068507‑2068640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |